Species identification of vaginal lactobacilli isolated in reproductive-age women

Isayeva A.S., Letarov A.V., Ilyina E.N., Borovskaya A.D., Muravyeva V.V., Ankirskaya A.S.

S.N. Vinogradsky Institute of Microbiology, Russian Academy of Sciences, Moscow; Research Institute of Physicochemical Medicine, Federal Biomedical Agency of Russia, Moscow; Academician V. I. Kulakov Research Center of Obstetrics, Gynecology, and Perinatology, Ministry of Health and Social Development of Russia, Moscow
Objective. To determine the species composition of microaerophilic lactobacilli in reproductive-age women in normocenosis, mesocenosis, and bacterial vaginosis.
Subjects and methods. Three hundred and eighty-sixty lactobacilli isolated from the vagina of 30 nonpregnant women of reproductive age, among whom 10 had normocenosis, 10 had mesocenosis, and 10 had bacterial vaginosis. Lactobacilli were identified from the protein spectrum by mass spectrometry. The authors studied the ability of all the isolates to synthesize hydrogen peroxide, as well as strain heterogeneity by repetitive element sequence-based polymerase chain reaction (REP-PCR) typing.
Results. Isolated 379 (98.2%) lactobacilli species were identified. Six species of the Lactobacillus genus with a great predominance of 3 species: L. crispatus, L. jensenii, and L. gasseri (94.7%) were isolated. In most women of each group, Lactobacillus isolates were represented as any one species: L. crispatus (59.4%) in normocenosis, L. jensenii (53.6%) in mesocenosis, and all three leading species (30% each) in bacterial vaginosis. In women with normocenosis, 96.7% of the Lactobacillus isolates produced hydrogen peroxide, in mesocenosis, 30% of the isolates lost this capacity, and in bacterial vaginosis, the latter was absent in almost 50% of the isolates. The isolates that were from one woman and belonged to one species did not differ in PCR-derived genomic fingerprints, which suggests that they belong to one strain, but at this time the isolates show varying capacities to produce hydrogen peroxide.
Conclusion. The resident vaginal microflora in reproductive-age women shows a predominance of 3 Lactobacillus species (L. crispatus, L. jensenii, L. gasseri) regardless the vaginal microbiota (normocenosis, mesocenosis, or bacterial vaginosis). Individual Lactobacillus populations are homogeneous in terms of species composition in the majority of women; the isolates genetically belong to one strain, but may differ in their ability to produce hydrogen peroxide, which counts in favor of the opinion as to the epigenomic inheritance of this sign.

Keywords

vaginal Lactobacillus species
mass spectrometry
the state of vaginal microbiota
reproductive age

Частота оппортунистических инфекций влагалища имеет тенденцию к росту, несмотря на все расширяющийся арсенал применяемых в клинической практике антимикробных средств [2]. Механизмы развития этой патологии до настоящего времени остаются нераскрытыми. Расшифровать их невозможно без детального изучения связей макроорганизма и микробиоты влагалища здоровых женщин. Представление о Lactobacillus acidophilus как о практически единственном представителе нормальной микрофлоры влагалища со времен Дедерлейна непоколебимо просуществовало почти столетие. Только с внедрением молекулярно-генетических методов исследования появилась возможность на новом методическом уровне изучать композиционные особенности состава микробиоты влагалища, которая играет важную роль в колонизационной резистентности этого органа как защитного барьера репродуктивной системы в целом [3, 4, 8]. Первые исследования показали значительное видовое разнообразие лактофлоры и отличия ее в разных этнических группах женщин и в различных регионах мира, что, по-видимому, является генетически обусловленным [3, 6]. Такие исследования могут стать базой для новых терапевтических стратегий в лечении влагалищных инфекций, вызванных условно-патогенными микроорганизмами, а также основой для отбора штаммов при создании биопрепаратов.

В России не было систематических исследований по видовой идентификации влагалищных
лактобацилл у женщин различных возрастных групп и при различном состоянии микроценоза
(микробиоты) влагалища. Проблема внутривидового (штаммового) разнообразия лактобацилл
также практически не изучена ни в России, ни в других странах.

Целью настоящего исследования было определить видовой состав лактобацилл у женщин
репродуктивного возраста при различном состоянии микробиоты влагалища: при нормоценозе,
промежуточной форме (мезоценозе) и бактериальном вагинозе.

Материал и методы исследования

Изучено 386 изолятов лактобацилл, полученных из отделяемого влагалища 30 небеременных
женщин репродуктивного возраста. Были сформированы 3 группы по 10 женщин в зависимости
от результатов микробиологической диагностики состояния микробиоты влагалища: «нормоценоз», «бактериальный вагиноз» и «мезоценоз». Оценку состояния микроценоза влагалища проводили на основе критериев R.P. Nugent [7], модифицированных нами [1].

Посев отделяемого влагалища (образец), взятого стерильным дакроновым тампоном, проводили на чашку Петри с плотной селективной минерально-растительной средой (МРС). Посевы культивировали в течение 48 ч в микроаэрофильных условиях при температуре 37 ˚С. Из каждого образца отбирали по 10–15 колоний (изолятов), по возможности, разной морфологии, которые по предварительным тестам (рост на селективной среде, грамположительные каталазоотрицательные палочки) были отнесены к роду Lаctobacillus. Каждый изолят рассевали петлей методом истощения до получения морфологически однородных отдельных колоний (морфологию колоний контролировали с использованием бинокулярного стереомикроскопа) и отсевали в жидкую среду МРС для накопления биомассы.

Видовую идентификацию всех 386 клинических изолятов проводили по белковому спектру методом MALDI TOF масс-спектрометрии, используя масс-спектрометр Microflex и программный продукт MALDI Biotyper 2.0 фирмы Bruker Daltonics (Германия) в соответствии с инструкциями производителя.

Все изоляты были дифференцированы по такому клинически важному признаку, как способность образовывать перекись водорода. Для этого колонии лактобактерий рассевали петлей на чашки, содержащие пероксидазу хрена и тетраметилбензидин [5] (в нашем случае диаминобензидин). Чашки инкубировали при 37 °С в микроаэрофильных условиях 24 ч. Продуцирующие перекись водорода колонии окрашивались в коричневый цвет, так как пероксидаза хрена в питательной среде окисляет диаминобензидин в присутствии перекиси водорода [5]. Для определения возможной штаммовой гетерогенности изолятов, выделенных от одной и разных женщин, был использован метод REP-ПЦР типирования [4].

Результаты исследования

Результаты видовой идентификации 386 первичных изолятов лактобацилл, полученных от женщин трех групп, представлены в табл. 1.

Таблица 1. Видовая идентификация лактобацилл, выделенных у наблюдаемых женщин.

Как следует из табл. 1, только 7 (1,8 %) изолятов из 386 не могли быть идентифицированы до вида с помощью системы MALDI Biotyper 2.0. У обследованных женщин было выделено 6 видов рода Lactobacillus со значительным превалированием трех видов (L. crispatus, L. jensenii и L. gasseri), которые составили в сумме 94,7% от всех идентифицированных изолятов. Большинство изолятов прошли идентификацию с высокой степенью достоверности (score>2,0). Исключение составили изоляты вида L. jensenii, которые более чем в половине случаев (75 из 130) – 57,7 % показали видовую идентификацию с низкими показателями score (>1,7–<2,0). Возможно, это связано с тем, что в базе данных MALDI Biotyper 2.0 на данный момент содержится лишь ограниченное число штаммов этого вида, и такой результат в нашем исследовании можно объяснить естественным внутривидовым разнообразием лактобацилл.

Связь видового состава лактобацилл с различными состояниями микробиоты влагалища представлена в табл. 2.

Таблица 2. Видовой состав лактобацилл при различном состоянии микробиоты влагалища.

Как видно из табл. 2, при нормоценозе у обследованных женщин выделены лактобациллы только трех видов: ведущим был вид L. crispatus, составивший 59,3% среди выделенных изолятов, виды L. jensenii и L. gasseriбыли выделены из 22,0 и 18,7% изолятов соответственно. При этом обращало на себя внимание, что у каждой из 10 женщин с нормоценозом все выделенные изоляты были представлены только одним видом лактобацилл.

При бактериальном вагинозе те же три вида лактобацилл практически встречались с равной частотой (примерно по 30 % изолятов каждого вида). Kроме того, 15 (11,8%) изолятов были идентифицированы как L. acidophilus (все выделены у одной женщины). Только у одной пациентки с бактериальным вагинозом было 2 вида лактобацилл, у остальных 9 – все изученные изоляты принадлежали к какому-либо одному виду лактобацилл.

При мезоценозе 53,6% изолятов идентифицированы как L. jensenii. Виды L. gasseri и L. crispatus составили 27,1 и 17,8% соответственно. На долю других видов (L. salivarius и L. johnsonii) пришлось только 5 изолятов, которые были выделены у двух женщин в комбинации с ведущими видами лактобацилл. У 7 женщин присутствовал лишь один вид лактобацилл, у двух – по два вида и у одной женщины среди 15 изолятов было 3 вида лактобацилл. Таким образом, как при нормоценозе, так и при мезоценозе и бактериальном вагинозе, у подавляющего большинства обследованных женщин изоляты лактобацилл были представлены каким-либо одним видом.

У всех изолятов была проверена способность к продукции перекиси водорода, как одного из ведущих защитных свойств индигенной микрофлоры. Полученные результаты редставлены
в табл. 3.

Таблица 3. Продукция перекиси водорода у изолятов различных видов лактобацилл в зависимости от состояния микробиоты влагалища.

Как видно из табл. 3, при нормоценозе подавляющее большинство изолятов (96,7%) продуцировали
перекись водорода, при мезоценозе – 30% изолятов теряли такую способность, а при бактериальном вагинозе почти половина изолятов лактобацилл не продуцировали перекись водорода.

Можно отметить, что изоляты L. crispatus чаще сохраняли способность к продукции перекиси водорода (даже при бактериальном вагинозе) по сравнению с другими видами лактобацилл.

Обращало на себя внимание, что только у одной женщины способность к синтезу перекиси водорода отсутствовала у всех изолятов одного вида. Чаще изоляты, различающиеся по данному признаку, присутствовали одновременно в различных соотношениях. Так как в анализ попала небольшая выборка от каждой женщины, трудно судить о клиническом значении полученных данных. Тенденция к увеличению числа лактобацилл, не продуцирующих перекись водорода, более четко выявлялась при патологическом состоянии микрофлоры влагалища. При бактериальном вагинозе у 7 из 10 женщин были выявлены варианты лактобацилл, не продуцирующие перекись водорода, при мезоценозе – у 3 из 10, тогда как при нормоценозе – только у 1 из 10.

Для определения идентичности или различий изолятов лактобацилл одного вида, выделенных у одной
пациентки или от разных женщин, было проведено типирование ряда изолятов с помощью геномного
ПЦР-фингерпринта методом RЕР-ПЦР. Показано, что изоляты, выделенные от одной пациентки и принадлежащие к одному виду, не отличались по паттернам полос (рис. 1, см. на вклейке).

Это свидетельствует о генетической однородности изолятов и, следовательно, принадлежности их к
одному штамму. Но при этом имела место разная способность изолятов образовывать перекись водорода. В то же время изоляты одного вида лактобацилл, выделенные от разных женщин, как правило, отличались по ПЦР-паттернам, что позволяет относить их к разным штаммам (рис. 2, см. на вклейке).

Обсуждение

Использование новой технологии – масс-спектрометрического анализа белковых молекул для
видовой идентификации микроорганизмов – позволило идентифицировать в составе влагалищной микробиоты женщин репродуктивного возраста несколько видов лактобацилл. Однако три вида ( L. crispatus, L. gasseri и L. jensenii ) были абсолютно доминирующими (93,0%) среди микроаэрофильных лактобацилл независимо от состояния микробиоты влагалища (нормоценоз, мезоценоз или бактериальный вагиноз). В данном исследовании нас интересовало, имеет ли место видовое разнообразие лактобацилл при различном микробиологическом диагнозе. Поэтому мы не учитывали количественные характеристики видовых популяций лактобактерий и у всех наблюдаемых женщин отбирали одинаковое число первичных изолятов лактобацилл (10–15). Изучение 386 изолятов от 30 женщин показало, что индивидуальные популяции лактобацилл у большинства женщин гомогенны по видовому составу, реже содержат два (еще реже три) различных вида лактобацилл.

Исследование внутривидовой гетерогенности индивидуальных популяций лактобацилл мы проводили с помощью RЕР-ПЦР. Однако разрешающая способность RЕР-ПЦР не позволяет различать близкородственные штаммы, которые могут отличаться некоторыми экологически существенными признаками. К сожалению, наши попытки создать более высокоразрешающую систему, пригодную для высокопроизводительного типирования лактобацилл, пока не увенчались успехом. Тем не менее полученные результаты свидетельствуют в пользу предположения о клональной гомогенности большинства индивидуальных популяций. В то же время фингерпринты лактобацилл, выделенных от разных женщин, достоверно различались. Эти результаты позволяют предположить, что популяции вагинальных лактобацилл не подвергаются продолжительному воздействию штамм-специфичных
селективных факторов, зависящих от плотности популяции (таких, как фаговая инфекция). В то же
время имеется тенденция к уменьшению гомогенности лактобацил при мезоценозе, что может быть
вызвано действием неидентифицированных факторов, влияющих на различные штаммы с различной
интенсивностью.

Изоляты, выделенные от одной женщины и идентичные по паттернам RЕР-ПЦР (то есть принадлежащие к одному штамму), в ряде случаев различались по признаку продукции перекиси водорода. Это свидетельствует о возможном эпигеномном наследовании данного признака (как стабильного физиологического состояния). Возможно также, что утрата или приобретение способности к продукции перекиси водорода связана с точечными мутациями, не выявляемыми ПЦР-фингерпринтом. Вопросы о механизмах генетической детерминации и регуляции продукции перекиси водорода у лактобацилл, а также возможности и частоты изменения этого признака in situ практически не изучены и требуют дополнительного исследования.

Обнаружение нами факта гомогенности большинства индивидуальных популяций лактобацилл вызывает вопрос о стабильности ассоциации макроорганизма и доминирующего штамма этих бактерий. Возможно, колонизация влагалища у определенной женщины именно этим штаммом лактобацилл является не случайной, а отражает взаимное соответствие особенностей организма-хозяина и свойств микроорганизма. Например, степень выраженности адгезии лактобацилл к эпителию влагалища может зависеть от индивидуальных различий поверхностных белков эпителиальных клеток и штаммовых различий бактерий по набору и экспрессии адгезинов. В таком случае это явление следует учитывать при создании вагинальных пробиотиков. Возможно, окажется целесообразным проводить индивидуальный подбор пробиотического штамма с целью достижения наиболее эффективной и стойкой колонизации влагалища.

Работа поддержана грантами ГК № 02.740.11.0313с Минобрнауки, РФФИ № 09-04-01482-а и программы Президиума РАН «Фундаментальные науки – медицине».

References

Ankirskaja A.S., Murav'eva V.V. Laboratornaja diagnostika opportunisticheskih infekcij vlagaliwa // Consilium medicum. – 2005. – T. 7, № 3. – S. 206–210.
2. Kira E.F. Kombinirovannaja terapija infekcionnyh zabolevanij zhenskih polovyh organov // Ginekologija. – 2010. – T. 12, № 1. – S. 26–29.
3. Antonio M. A. D., Hawes S. E., Hillier S. L. Identification of vaginal Lactobacillus species and the demographic and microbiologic characteristics of women colonized by these species // J. Infect. Dis. – 1999. – Vol. 180. – P. 1950–1956.
4. Antonio M.A.D., Hiller S.L. DNA fingerprinting of Lactobacillus crispatus strain CTV-05 by repetitive element sequence-based PCR analysis in a pilot study of vaginal colonization // J. Clin. Microbiol. – 2003. – Vol. 41, № 5. – P. 1881–1887.
5. Eschenbach D.A., Davick P.R., Williams B.L. et al. Prevalence of hydrogen peroxide–producing Lactobacillus species in normal women and women with bacterial vaginosis // J. Clin. Microbiol. – 1989. – Vol. 27. – P. 251–261.
6. Kiliç A.O., Pavlova S.I., Alpay S. et al. Comparative study of vaginal Lactobacillus phages isolated from women in the United States and Turkey: prevalence, morphology, host range, and DNA homology // Clin. Diagn. Lab. Immunol. – 2001. – Vol. 8, № 1. – P. 31–39.
7. Nugent R.P., Krohn M.A., Hiller S.L. Reliability of diagnosing bacterial vaginosis in improved by a standardized method of gram stain interpretation // J. Clin. Microbiol. – 1991. – Vol. 29, № 2. – P. 297–301.
8. Stoyancheva G. D., Danova S. T., Boudakov I. Y. Molecular identification of vaginal lactobacilli isolated from Bulgarian women // Antonie van Leeuwenhoek. – 2006. – Vol. 90. – P. 201–210.

About the Authors

Ankirskaya Alla
E-mail: a_ ankirskaya@oparina4.ru

Similar Articles

By continuing to use our site, you consent to the processing of cookies that ensure the proper functioning of the site.