Cervical intraepithelial neoplasia: Analysis of mRNA profile in the practice of liquid-based cytology

Melnikova N.V., Bozhenko V.K., Antonova I.B., Babaeva N.A., Yarovaya N.Yu., Bolotina N.A., Zakharenko M.V., Senchukova A.L., Akopova N.B., Aleksandrova N.V., Burmenskaya O.V., Ashrafyan L.A.

1Russian Research Center of Roentgenology and Radiology, Ministry of Health of Russia, Moscow 117997, Profsoyuznaya str. 86, Russia 2Research Center of Obstetrics, Gynecology, and Perinatology, Ministry of Health of Russia, Moscow 117997, Ac. Oparina str. 4, Russia
Objective. To assess whether patients with CIN 2+ and CIN1 or less can be differentiated based on the mRNA expression of a 21-gene panel by quantitative PCR in the material of preservative fluid collection vials with CellPrep PAP test samples.
Subjects and methods. The mRNA expression level of 21 genes (Ki-67, STK-15, CCNB1, CCND1, MYC, MYBL2, P16INK4A, PTEN, BIRC5, BCL2, BAG1, TERT, NDRG1, ESR1, PGR, HER2, GRB7, MGB1, MMP11, CTSL2, and CD68) was determined by quantitative PCR in the material of preservative fluid collection vials after CellPrep PAP test in 59 patients who had been treated at the Russian Research Center of Roentgenology and Radiology in 2015-2016. The test of significance was the results of comparison with subsequent histological examination.
Results. Discriminant analysis has established that a combined assessment of ESR1 and MYBL2 mRNA expression levels allows correct classification in 88.24% of cases of CIN2+ changes and in less than 84.0% of cases of histologically confirmed CIN1. The combined assessment of mRNA expression levels of 17 genes (ESR1, MYBL2, CD68, PTEN, CCND1, BCL2, HER2, MMP11, TERT, STK15, P16INK4A, BAG1, CTSL2, KI67, CCNB1, GRB7, and NDRG1) permits differentiation of CIN 2+ and CIN1 or less cases with an accuracy at 98.3%. The coincidence rate of the classification with the data of histological examination was 100.0% for the CIN2+ group and 96.0% for the histologically confirmed CIN1 or less group.
Conclusion. It has been shown for the first time that the mRNA expression of a large group of genes can be analyzed by quantitative PCR in the material of CellPrep liquid-based cytology in the PAP test. Assessment of the expression of a panel of 21 genes, which complements the preoperative morphological diagnosis of precancerous processes and cancer of the cervix uteri in the material of liquid-based cytology, allows a high-precision differential diagnosis of 2 clinically important groups, such as the CIN 2+ and CIN1 or less ones (intact epithelium/benign tissue changes of the cervix).

Keywords

cervical pathology
gene expression
mRNA
liquid-based cytology
cytology

Заболеваемость раком шейки матки (РШМ) в Российской Федерации с 2005 по 2015 гг. возросла на 24,47% случаев, составив 21,27 случая на 100 000 населения в 2015 году [1]. Неблагоприятные эпидемиологические тенденции РШМ диктуют необходимость совершенствования методов ранней диагностики на новом технологическом уровне с внедрением в клиническую практику последних достижений молекулярной биологии.

По данным отечественной литературы даже изолированное тестирование мРНК гена р16 (INK4a) методом количественной полимеразной цепной реакции (ПЦР) (в материале традиционного соскоба шейки матки) может быть использовано в качестве дополнительного маркера прогнозирования распространенных поражений шейки матки [2].

Дифференциально-диагностическая панель маркеров для оценки цервикальной интраэпителиальной неоплазии (CIN) и РШМ должна включать комплексный анализ экспрессии мРНК BCL-2, BAG, циклина В1, Ki-67 и рецепторов эстрогена [3]. Однако указанные исследования, как и большинство других, проведены на образцах биопсийного и операционного материала. В настоящее время особый интерес вызывает возможность анализа нуклеиновых кислот и в особенности РНК в материале, получаемом для жидкостной цитологии.

В литературе описан целый ряд работ, в которых указывается на возможность проведения таких исследований. M. Del Pino и соавт. (2015) впервые сообщили об обнаружении мРНК клеточных биомаркеров в материале консервирующей жидкости флакона с образцом Пап-теста ThinPrep [4]. Исследователи отмечают, что сочетанная оценка TOP2A и CDKN2A/р16 в данном материале обладает достаточным соотношением чувствительности и специфичности для выявления женщин с высокой степенью плоскоклеточного интраэпителиального поражения (HSIL). H.Y. Wang и соавт. (2015) на основе комплексной оценки уровней мРНК онкопротеинов Е6 и Е7 вируса папилломы человека (ВПЧ) и белка теломеразной обратной транскриптазы человека (hTERT) в материале флакона Пап-теста ThinPrep (545 образцов) приходят к выводу, что сочетанная оценка указанных маркеров может использоваться взаимодополняющим образом при диагностике поражений шейки матки высокой степени злокачественности, а также являться прогностическим маркером при мониторинге заболеваний шейки матки низкой степени злокачественности [5].

Таким образом, определение мРНК в материале консервирующего раствора Пап-теста с использованием количественной ПЦР позволит расширить возможности дифференциальной диагностики CIN различной степени тяжести, рака in situ и инвазивного РШМ.

Цель исследования – оценить возможность проведения дифференцировки пациенток с CIN 2+ и CIN1 на основе экспрессии 21-генной панели мРНК методом количественной ПЦР в материале консервирующей жидкости флакона с образцами Пап-теста CellPrep.

Материал и методы исследования

В исследование включены 59 пациенток, проходивших лечение в ФГБУ РНЦРР Минздрава России в 2015–2016 гг.

Для всех образцов проводили ретроспективный анализ материала консервирующей жидкости флакона с образцом Пап-теста CellPrep (Biodyne Co., LTD, Корея). Забор материала для цитологического исследования выполнялся при помощи набора расходных материалов для диагностики онкологических заболеваний шейки матки (Biodyne Co., LTD, Корея).

Подготовка тонкослойных цитологических препаратов из материала флакона с консервирующим раствором выполнена при помощи процессора для приготовления препаратов для тонкослойного цитологического исследования CellPrep Plus 4.63 (Biodyne Co., LTD, Корея). После фиксации в течение 30 минут в 95% растворе этанола окрашивание стеклопрепаратов по Папаниколау выполнено на Autostainer Leica XL (Leica Microsystems Nussloch GmbH) с использованием красителей Leica Surgipath EA-50, OG6, гематоксилин Гарриса. Категоризация цитологических заключений выполнена согласно классификации Bethesda.

Уровень экспрессии мРНК 21 гена (Ki-67, STK-15, CCNB1, CCND1, MYC, MYBL2, P16INK4A, PTEN, BIRC5, BCL2, BAG1, TERT, NDRG1, ESR1, PGR, HER2, GRB7, MGB1, MMP11, CTSL2, CD68) определяли методом количественной ПЦР, описанным ранее с использованием наборов ЗАО «ДНК технология» [6]. Критерием достоверности были результаты сопоставления с плановым гистологическим исследованием биопсийного и операционного материала. Гистологические заключения давались в соответствии с гистологической классификацией опухолей женской половой системы (ВОЗ, 2003 г.) [7].

Хранение материала до начала исследования осуществляли при температуре 4°С.

Статистическую обработку результатов исследования проводили с использованием метода дискриминантного анализа. Различие групп считали статистически значимым при Р<0,05. Обработку полученных результатов проводили в программном пакете Statistica 7.0 (Stat Soft, США).

Распределение пациенток по возрасту и гистологическим заключениям представлено в табл. 1.

Результаты исследования и обсуждение

Во всех 59 (100%) случаях методом количественной ПЦР определена экспрессия мРНК 24 генов, включая 3-хаускипинга, в материале консервирующей жидкости флакона с образцами Пап-теста CellPrep (табл. 2).

Анализ полученных результатов экспрессии 21 гена выявил достоверные отличия уровней экспрессии большей части исследованных генов в группах CIN 2+ и CIN1 или менее. Так, пошаговый дискриминантный анализ свидетельствует, что использование полученного алгоритма, включающего оценку уровней экспрессии мРНК 17 генов (ESR1, MYBL2, CD68, PTEN, CCND1, BCL2, HER2, MMP11, TERT, STK15, P16INK4A, BAG1, CTSL2, KI67, CCNB1, GRB7, NDRG1) позволяет с точностью до 98,3% случаев провести дифференцировку групп CIN 2+ и CIN1 или менее. Совпадение классификации с данными гистологического исследования для группы CIN2+ составило 100,0% случаев, а для группы с гистологически подтвержденной CIN1 или менее – 96,0% случаев.

В 1 случае гликогеновой дистрофии значения молекулярно-биологических параметров ошибочно отнесли наблюдение к группе CIN 2+ при совпадении данных цитологического и гистологического исследования.

Итоги анализа дискриминантных функций выявили, что наибольшее значение на правильность классификации оказывает оценка мРНК экспрессии генов ESR1, CD68, PTEN, CCND1, BCL2, HER2, STK15, BAG1.

Нашей задачей было оптимизировать практическое применение полученных данных для будущего практического использования. Пошаговый дискриминантный анализ мРНК 21 гена с исключением оставляет 2 переменных в модели, позволяющих дифференцировать CIN2+/CIN1 или менее с суммарной точностью 86,44% случаев (табл. 3).

Достоверное снижение экспрессии рецепторов эстрогена характеризовало группу с гистологически установленными изменениями не менее чем CIN2+ (p=0,00001). Наши результаты согласуются с данными I. Zhai и соавт. (2010), отмечающими низкий уровень экспрессии ESR1 в большинстве случаев инвазивного РШМ в сравнении с неинвазивными цервикальными изменениями [8].

Помимо оценки экспрессии мРНК рецепторов эстрогена α, модель включает оценку экспрессии мРНК гена MYBL2, являющегося членом семейства протоонкогенов MYB, участвующих в пролиферации и контроле клеточной дифференцировки. Группа CIN2+ характеризуется более выраженной экспрессией данного маркера (p=0,001433).

K. Astbury и соавт. (2011) выявили гиперэкспрессию MYBL2 при помощи TaqMan ПЦР в клеточных линиях РШМ [9]. Авторы отмечают, что при иммуногистохимическом исследовании окрашивание с антителами к MYBL2 преимущественно отсутствует в нормальном эпителии шейки матки при выраженной позитивной экспрессии в CIN и инвазивном РШМ, позволяя относить оценку его экспрессии к потенциальным биомаркерам РШМ.

Использование сочетанной оценки экспрессии только двух генов ESR1 и MYBL2 позволяет верно классифицировать группу CIN2+ в 88,24% случаев, а группу CIN1 или менее – в 84,0% случаев. С точки зрения практической реализации внедрение данной двугенной модели, как дополнительной тест-системы, представляется наиболее перспективным в практике плановых и скрининговых обследований.

Заключение

Таким образом, в данной работе впервые показана возможность анализа экспрессии мРНК большой группы генов методом количественной ПЦР в материале жидкостной цитологии Пап-теста CellPrep. Полученные результаты оценки уровня экспрессии группы генов (всего проанализирована экспрессия 24 генов, из которых 3-хаускипинги, использованные для нормировки) позволили дифференцировать образцы на группы, соответствующие CIN 2+ и CIN1 или менее. Проведенный дискриминантный анализ показал, что в дифференциальную диагностику больший вклад вносит оценка экспрессии мРНК генов ESR1 и MYBL2 методом количественной ПЦР, что позволяет отличить группу CIN 2+ от группы CIN1 или менее с точностью 86,44% случаев. Следовательно, оценка экспрессии панели 21 генов, дополняющая морфологическую дооперационную диагностику предраковых процессов и РШМ по материалу жидкостной цитологии, позволяет с высокой точностью проводить дифференциальную диагностику патологических процессов шейки матки.

Дифференцированный подход ведения пациенток с CIN различной степени тяжести используется и представлен как консервативными, так и оперативными подходами. Выбор каждого метода должен быть строго обоснованным, особенно у пациенток репродуктивного возраста, ориентированных на органосохраняющее лечение. Молекулярно-биологическое тестирование по материалам жидкостной цитологии позволяет провести внутринозологическую диагностику и определить тактику дальнейшего лечения. Дополнительные исследования на большем объеме клинического материала позволят верифицировать пороговые значения экспрессии для каждого из анализируемых генов, что создаст дополнительный метод уточняющей дифференциальной диагностики клинически значимых изменений эпителия шейки матки, перспективный с точки зрения плановых и скрининговых исследований.

References

1. Kaprin A.D., Starinsky V.V., Petrova G.V., ed. Malignant neoplasms in Russia in 2015 (morbidity and mortality). Moscow: MNIOI im. P.A. Herzen – branch of FGBU „NIIRTs” of the Ministry of Health of Russia; 2017. 250s. Available at: http://www.oncology.ru/service/statistics/malignant_tumors/2015.pdf (in Russian)

2. Bozhenko V.K., Kudinova E.A., Bliznyukov O.P., Melnikova N.V., Burmenskaya O.V. Patent for invention RUS 2464570, IPC G01N33 / 53. The method of diagnosis of cervical intraepithelial neoplasia. Applicant and patent holder of FGU „RNSRD” of the Ministry of Health and Social Development of Russia (RU). No. 2010147074/15; Declared on 19.11.2010; Publ. 20.10.2012; Bul. №29. 9p. (in Russian)

3. Bozhenko V.K., Ashrafyan L.A., Antonova I.B., Mel’nikova N.V., Burmenskaya O.N., Trofimov D.Yu., Kudinova E.A., Hunova L.Z., Slonov A.V., Bliznyukov O.P. Analysis of the expression of proliferation and apoptosis genes in cervical intraepithelial neoplasia and cervical cancer. Opuholi zhenskoj reproduktivnoj sistemy. 2011;4:72-75 (in Russian)

4. Del Pino M., Svanholm-Barrie C., Torné A., Marimon L., Gaber J., Sagasta A. et al. mRNA biomarker detection in liquid-based cytology: a new approach in the prevention of cervical cancer. Mod. Pathol. 2015; 28(2): 312-20. doi: 10.1038/modpathol.2014.106.

5. Wang H.Y., Park S., Kim S., Lee D., Kim G., Kim Y. et al. Use of hTERT and HPV E6/E7 mRNA RT-qPCR TaqMan assays in combination for diagnosing high-grade cervical lesions and malignant tumors. Am. J. Clin. Pathol. 2015; 143(3): 344-51. doi: 10.1309/AJCPF2XGZ2XIQYQX.

6. Bozhenko V.K., Vaskevich E.F., Trofimov D.Yu., Burmenskaya O.V., Kudinova E.A., Hunova L.Z. Analysis of changes in the profile of gene expression in hyperproliferative diseases of the cervix. Klinicheskaya laboratornaya diagnostika. 2011;9: 21 (in Russian)

7. Tavassoli F.A., Devilee P., eds. Pathology and genetics of tumours of the breast and female genital organs. Lyon: IARC; 2003. 432p.

8. Zhai Y., Bommer G.T., Feng Y., Wiese A.B., Fearon E.R., Cho K.R. Loss of estrogen receptor 1 enhances cervical cancer invasion. Am. J. Pathol. 2010; 177(2): 884-95. doi: 10.2353/ajpath.2010.091166.

9. Astbury K., McEvoy L., Brian H., Spillane C., Sheils O., Martin C. et al. MYBL2 (B-MYB) in cervical cancer: putative biomarker. Int. J. Gynecol. Cancer. 2011;21(2): 206-12. doi: 10.1097/IGC.0b013e318205759f.

Received 03.02.2017

Accepted 17.02.2017

About the Authors

Melnikova Nadezhda Vasilevna, Ph.D., Leading Researcher of the Laboratory of Immunology, oncocytology and cell therapy in oncology, Russian Research Center of Roentgenology and Radiology, Ministry of Health of Russia. 117997 Russia, Moscow, Profsoyuznaya str. 86. Tel.: +74953339130. E-mail: n_melnikova@list.ru
Bozhenko Vladimir Konstantinovich, MD, Head of the Department of Molecular Biology and Experimental Tumor Therapy, Russian Research Center of Roentgenology and Radiology, Ministry of Health of Russia. 117997 Russia, Moscow, Profsoyuznaya str. 86. Tel.: +74991201114. E-mail: vbojenko@mail.ru
Antonova Irina Borisovna, MD, Head of the Laboratory of prevention, early diagnostics and combination treatment of cancer diseases, Russian Research Center of Roentgenology and Radiology, Ministry of Health of Russia. 117997 Russia, Moscow, Profsoyuznaya str. 86. Tel.: +74991206077. E-mail: iran24@yandex.ru
Babaeva Nataliya Aleksandrovna, MD, Leading researcher of Laboratory of prevention, early diagnostics and combined treatments of cancer diseases, Russian Research Center of Roentgenology and Radiology, Ministry of Health of Russia. 117997 Russia, Moscow, Profsoyuznaya str. 86. Tel.: +74991206077. E-mail: natbabaeva@yandex.ru
Yarovaya Nataliya Yurevna, Ph.D., Head of the Laboratory of Cytology at the Pathology department, Russian Research Center of Roentgenology and Radiology,
Ministry of Health of Russia. 117997 Russia, Moscow, Profsoyuznaya str. 86. Tel.: +74991201114. E-mail: natalya-yarovaya@yandex.ru
Bolotina Nataliya Aleksandrovna, Ph.D., Pathologist at the Pathology department, Russian Research Center of Roentgenology and Radiology, Ministry of Health of Russia. 117997 Russia, Moscow, Profsoyuznaya str. 86. Tel.: +74953339130. E-mail: soloma-natali@yandex.ru
Zakharenko Margarita Vladimirovna, Junior Researcher of the Laboratory of Immunology, oncocytology and cell therapy in oncology, Russian Research Center of Roentgenology and Radiology, Ministry of Health of Russia. 117997 Russia, Moscow, Profsoyuznaya str. 86. Tel.: +74991201114. E-mail: zak-margarita@mail.ru
Senchukova Anna Leonidovna, Ph.D., Researcher of the Laboratory of Immunology, oncocytology and cell therapy in oncology, Russian Research Center of Roentgenology and Radiology, Ministry of Health of Russia. 117997 Russia, Moscow, Profsoyuznaya str. 86. Tel.: +74991201114. E-mail: asenchukova@gmail.com
Akopova Nataliya Borisovna, Ph.D., Obstetrician-gynecologist of the Department of Radiation and instrumental diagnostics of tumor diseases of the reproductive organs, Russian Research Center of Roentgenology and Radiology, Ministry of Health of Russia. 117997 Russia, Moscow, Profsoyuznaya str. 86. Tel.: +74991206077
Aleksandrova Nataliya Vladimirovna, MD, Research Center of Obstetrics, Gynecology and Perinatology, Ministry of Health of Russia.
117997, Russia, Moscow, Ac. Oparina str. 4. E-mail: alexandrova.ncagip@gmail.com
Burmenskaya Olga Vladimirovna, MD, Senior Researcher of Laboratory molecular genetic factors, Research Center of Obstetrics, Gynecology and Perinatology,
Ministry of Health of Russia. 117997, Russia, Moscow, Ac. Oparina str. 4. Tel.: +79167531709. E-mail: bourmenska@mail.ru
Ashrafyan Levon Andreevich, MD, Professor, Head of the Department of Early carcinogenesis, prevention, diagnostics and comprehensive treatment of oncological diseases of female reproductive organs, Russian Research Center of Roentgenology and Radiology, Ministry of Health of Russia.
117997 Russia, Moscow, Profsoyuznaya str. 86. Tel.: +74953349909

For citations: Melnikova N.V., Bozhenko V.K., Antonova I.B., Babaeva N.A., Yarovaya N.Yu., Bolotina N.A., Zakharenko M.V., Senchukova A.L., Akopova N.B., Aleksandrova N.V., Burmenskaya O.V., Ashrafyan L.A. Cervical intraepithelial neoplasia: Analysis of mRNA profile in the practice of liquid-based cytology. Akusherstvo i Ginekologiya/Obstetrics and Gynecology. 2017; (4): 95-100. (in Russian)
http://dx.doi.org/10.18565/aig.2017.4.95-100

Similar Articles

By continuing to use our site, you consent to the processing of cookies that ensure the proper functioning of the site.