Association of TNF and TGFB1 gene polymorphisms with a predisposition to vaginitis in reproductive-aged women

Burmenskaya O.V., Bairamova G.R., Kadochnikova V.V., Prilepskaya V.N., Trofimov D.Yu.

1Academician V.I. Kulakov Research Center of Obstetrics, Gynecology, and Perinatology, Ministry of Health of Russia, Moscow 117997, Ac. Oparina str. 4, Russia; 2State Research Center Institute of Immunology, Federal Biomedical Agency of Russia, Moscow 115478, Kashirskoye sh. 24 bld. 2, Russia
Objective. To establish the distribution of allelic variants of the immune response genes associated with a predisposition to vaginitis in reproductive-aged women.
Subjects and methods. A polymerase chain reaction (PCR) assay was used to investigate 22 allelic variants of the immune response genes in 96 women with vaginitis. A comparison group consisted of 60 apparently healthy women without signs of genital tract inflammatory diseases. Peripheral blood samples were examined.
Results. The distribution of 22 allelic alleles of the immune response genes was established in the apparently healthy women and in the patients with vaginitis. The allelic variants of TNF (rs361525) and TGFB1 (rs1800469) polymorphisms, which were associated with the development of vaginitis, were ascertained. Both allelic variants result in the decreased TNF and TGFB1 mRNA expression, they are more common in the population, which can also cause the high prevalence of this gynecological disease.
Conclusion. There was a positive association of the C allele of the TGFB1-509 C>T locus (OR =1.8; CI: 1.1-2.9) and a negative association of the A allele of the TNF–238 G>A locus (OR = 0.21; CI: 0.07-0.68) with a predisposition to inflammatory diseases of the lower female genital tract.

Keywords

vaginitis
immune response gene polymorphisms
polymerase chain reaction by melting amplification products through the kissing balloon probe technique

В структуре акушерско-гинекологической заболеваемости воспалительные процессы нижних отделов генитального тракта занимают одно из ведущих мест, являясь причиной различных патологических состояний репродуктивной системы [1, 2]. В последние годы исследования многих авторов свидетельствуют о возросшей роли различных микроорганизмов и их ассоциаций в развитии воспалительных заболеваний органов нижнего отдела половых путей. Известно, что причиной вульвовагинитов и цервицитов могут быть не только абсолютные патогены (Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Trichomonas vaginalis и др.), но и условно-патогенные микроорганизмы (E. coli, Corynebacterium, Enterococcus spp., Streptococcus spp., Staphylococcus spp., Candida spp. и др.), встречающиеся в норме во влагалище здоровой женщины. По данным А.С. Анкирской каждая пятая пациентка гинекологической практики обращается в связи с неспецифическим вагинитом, а среди пациенток с патологическими белями частота его выявления возрастает в 4 раза [3]. В этой связи пристальное внимание исследователей обращено к изучению различных аспектов вышеуказанных патологических состояний.

В значительной степени развитие инфекционного процесса определяется состоянием мукозального иммунитета и зависит от иммунологической реактивности макроорганизма. В возникновении заболевания микробный фактор играет такую же роль, как и состояние макроорганизма и те обстоятельства, которые изменяют его иммунобиологические свойства [4]. К факторам, которым отводится существенная роль в поддержании вагинальной экосистемы, можно отнести функционирование иммунокомпетентных клеток и продукцию ими биологически активных соединений, таких как дефензины, иммуноглобулины и цитокины. Цитокины, как медиаторы взаимодействия клеток, служат основными регуляторами иммунных реакций и отражают состояние локального иммунитета. В настоящее время накоплены многочисленные данные о зависимости экспрессии цитокинов не только от патогенных факторов, но и от генетической вариабельности кодирующих их генов.

В частности накоплены данные об ассоциациях отдельных полиморфизмов генов цитокинов с такими нозологическими формами как вульвовагинальный кандидоз [5] и бактериальный вагиноз [6–10]. В данной работе различные нозологические формы вагинитов были исследованы в совокупности, включая случаи воспаления неустановленной этиологии. Использование такого подхода обосновано тем, что зачастую воспалительная реакция является неспецифической в отношении инициирующего патологического агента, поскольку в иммунном ответе в первую очередь задействованы механизмы врожденного иммунитета.

Цель работы: установить распределение аллельных вариантов генов иммунного ответа, ассоциированных с предрасположенностью к развитию вагинитов у женщин репродуктивного возраста.

Материал и методы исследования

Проведено комплексное клинико-лабораторное обследование 156 пациенток в возрасте от 19 до 45 лет (средний возраст 29,8±5,2 года), обратившихся в научно-поликлиническое отделение ФГБУ НЦАГиП им. В.И. Кулакова Минздрава России в период с июня 2012 по июль 2013 г., которое включало: сбор анамнестических данных, жалоб пациентки, осмотр слизистой вульвы, влагалища и шейки матки, бимануальное гинекологическое исследование, а также микроскопию мазков, окрашенных по Граму, исследование микрофлоры влагалища методом количественной полимеразной цепной реакции (ПЦР) в режиме реального времени. Критерии исключения из исследования – наличие патогенов: C. trachomatis, T. vaginalis, N. gonorrhoea, M. genitalium, T. pallidum. На основании полученных данных сформированы следующие группы пациенток:

  • I группа сравнения – условно здоровые женщины без признаков воспалительных заболеваний половых путей (n=60).
  • II группа – женщины с признаками вагинита (n=96). Вагинит был ассоциирован с вульвовагинальным кандидозом в 26,1% случаев, с наличием аэробных бактерий в 7,3%, анаэробных бактерий в 13,5%, с сочетанными формами аэробных и анаэробных бактерий в 8,3%, с сочетанными формами грибов и бактерий в 22,9%, с Ureaplasma spp. в количестве более 4lg ГЭ/мл в 3,1%, вагинит неясной этиологии имел место в 18,8% случаев.

Материалом для исследования аллельного полиморфизма генов были образцы периферической крови пациенток с добавленным в качестве консерванта раствором ЭДТА. Для определения полиморфизмов (замены одиночных нуклеотидов, single-nucleotide polymorphism – SNP) ДНК выделяли из ядер лимфоцитов по методу Higuchi [11] с модификацией. Метод основан на разрушении лимфоцитов с помощью лизирующего буфера, не влияющего на целостность мембран ядер лимфоцитов. ДНК из ядер выделяли с использованием наборов «Проба ГС» (ДНК-Технология, Россия). Для определения замен одиночных нуклеотидов использована ПЦР с плавлением продуктов реакции в присутствии «примыкающих» олигонуклеотидов (вариант метода adjacent probes, kissing probes) на реагентах и оборудовании производства ООО «НПО ДНК-Технология» (Москва). Особенностью реагентов данного производителя является получение кривых плавления по двум каналам флуоресценции (FAM и HEX), что повышает достоверность полученных результатов.

Исследованы следующие полиморфизмы: IL1A (rs1800587), IL1B (rs1143627, rs1143634, rs16944), IL1R1или IL1RA (rs2234650), IL1RN (rs315952), IL6 (rs1800795), IL10 (rs1800871, rs1800872, rs1800896), IL12B (rs3212227), IL18 (rs187238, rs1946518, rs1946519), INFG (rs2430561), TNF(rs1800629, rs361525) и TGFB1 (rs1800469, rs1982073=rs1800470), TLR2 (rs4986790), TLR4 (rs3804099), CCL2 (rs1024611).

Статистическую обработку данных проводили с помощью свободно распространяемого продукта WINPEPI версия 9.7 и SPSS 17.0 для Windows. Оценку соответствия выявленных частот генотипов закону Харди–Вайнберга проводили по критерию χ2-квадрат в сравнении с ожидаемыми частотами генотипов равновесного распределения. При попарном сравнении частот генотипов и аллелей между собой использовали точный критерий Фишера.

Статистическую ошибку распределения частот аллелей вычисляли по формуле: sp=sqrt(p*(1–p)/2N) (формула 1), где р – частота аллеля, N – число индивидов в выборке.

Для оценки ассоциаций рассчитывали отношение шансов (OR) по формуле: OR=ad/bc (формула 2), где а — число лиц с наличием анализируемого маркера среди больных; b — его отсутствие среди больных; c и d — число лиц соответственно с наличием и отсутствием маркера в контрольной группе.

Величина ОR=1 указывает на отсутствие ассоциации, ОR>1 – имеет место при положительной ассоциации (фактор риска) и ОR<1 – отрицательная ассоциация аллеля (или генотипа) с заболеванием (протективный фактор).

Отношение шансов (OR) приведено с 95% доверительным интервалом (CI).

Результаты исследования

Распределение частот генотипов для всех полиморфизмов группы сравнения соответствовало ожидаемым частотам генотипов равновесного распределения по закону Харди–Вайнберга. При сравнении результатов исследования в группе сравнения с данными литературы наилучшее соответствие получено для распределения аллелей в европейской популяции. Полученные данные о частотах встречаемости аллелей однонуклеотидных полиморфизмов в генах, продукты которых обеспечивают иммунный ответ, в группах исследования представлены в таблице. Помимо этого в таблице представлены данные о частотах аллелей и генотипов в европейской популяции.

Полученные нами данные о частотах встречаемости аллелей однонуклеотидных полиморфизмов в генах иммунной системы, в группе сравнения соответствуют данным по Европе за исключением локуса TGFB1–509 C>T. Частота аллеля С локуса TGFB1–509 C>T в 1,2 раза ниже в исследуемой группе сравнения, чем в популяции европеоидов (OR=0,54 (СI:0,36-0,8), р=0,028).

Частоты встречаемости аллелей при вагинитах сопоставлены с частотами встречаемости в группе сравнения. В группе женщин с вагинитами выявлены достоверные различия для аллеля А локуса TNF –238 G>A(OR=0,21 (CI: 0,07-0,68), p=0,004) и аллеля С локусаTGFB1 –509 C>T (OR=1,8 (CI: 1,1-2,9), p=0,015) (табл. 1).

Выявлена положительная ассоциация аллеля С локуса TGFB1 -509 C>T (OR=1,8 (CI: 1,1-2,9), p=0,015) с вагинитом (рис. 1). В группе женщин с вагинитами достоверно чаще отмечен гомозиготный генотип СC (OR=2,3 (CI: 1,2-4,4), p=0,016) по сравнению с условно здоровыми женщинами основной группы сравнения (аутосомно-рецессивная модель).

Помимо этого выявлена отрицательная ассоциация редкого аллеля А локуса TNF–238 G>A(OR=0,21 (CI: 0,07-0,68), p=0,004) с вагинитом (рис. 2). В группе женщин с вагинитами достоверно реже отмечен редкий гетерозиготный генотип GA (OR=0,19 (CI: 0,06-0,64, p=0,0035) по сравнению условно здоровыми женщинами основной группы сравнения (аутосомно-доминантная модель).

По остальным локусам достоверных отличий частот аллелей и генотипов в группе женщин с вагинитами по сравнению с группой сравнения не выявлено. Данные приведены в таблице.

Обсуждение

Полученные нами данные о частотах встречаемости аллелей однонуклеотидных полиморфизмов в генах иммунной системы, в группе сравнения соответствуют данным по Европе за исключением полиморфизма TGFB1 (rs1800469). Частота определения аллеля С локуса TGFB1 -509 C>T в 1,2 раза ниже в исследуемой группе сравнения, чем в популяции европеоидов. Вероятно, полученные расхождения связаны со спецификой смешанной русской популяции и спецификой выборки исследуемой группы сравнения (отсутствие строгого отбора по признаку воспалительных заболеваний половых путей в европейской популяции). Примечательно, что данные по европейской популяции и группе сравнения получены с помощью различных методик: полногеномного секвенирования ДНК и ПЦР соответственно. Косвенным показателем достоверности получаемых результатов может служить оценка соответствия распределения частот генотипов полиморфизма ожидаемым частотам генотипов равновесного распределения по закону Харди–Вайнберга, которое подтверждено в нашем исследовании. Данные по европейской популяции получены по опубликованным результатам Проекта «1000 геномов» [12, 13]. Цель данного проекта состояла в обнаружении, генотипировании и обеспечении точной информацию по гаплотипам полиморфизмов генома человека в различных популяциях: Европа, Восточная Азия, Южная Азия, Западная Африка и Америка. В проекте использованы высокопроизводительные технологии секвенирования «нового поколения». Учитывая объем исследования, описываются не только варианты аллелей, частота встречаемости которых в популяции составляет не менее 1% (классическое определение полиморфизма), но и варианты генов с частотой встречаемости от 0,1%. Участие в проекте принимают 9 Центров, используется 3 технологии секвенирования ДНК: 454 Sequencing (Roche), Solexa/Illumina (Illumina), SOLiD (AppliedBiosystems). В ходе реализации проекта исследуется расположение, частота аллелей и локальная структура гаплотипов около 15 млн. SNP и 1млн. вставок и делеций. Официальные данные по реализации данного проекта представлены на сайте: http://www.ensembl.org/index.html.

При сопоставлении результатов в группе сравнения и в группе женщин с вагинитами достоверные различия получены для полиморфизмов TNF (rs361525) и TGFB1 (rs1800469).

Ген TNF-α картирован на хромосоме 6p21.3, имеет размер 2762 п.н. и содержит 4 экзона. Известны более 30 полиморфных вариантов гена, но только около половины из них влияют на экспрессию TNF-α in vitro. Два полиморфизма в промоторной области гена –238 G>A (rs361525) и –308 G>A (rs1800629) по отношению к сайту начала транскрипции содержат замену гуанина на аденин. В исследованиях этих полиморфизмов in vitro показано увеличение продукции TNF-α в ответ на стимуляцию липополисахаридами [14, 15].

В проведенном нами исследовании установлено, что аллельный вариант A локуса TNF–238 G>A (rs361525) является протективным и встречается реже в группе женщин с вагинитами, чем в группе сравнения. По-видимому, высокая экспрессия TNF в ответ на стимуляцию паттернами условно-патогенных микроорганизмов эффективно стимулирует иммунокомпетентные клетки и способствует своевременной элиминации возбудителя на ранних стадиях заболевания.

Ген TGFB1 картирован на хромосоме 19q13.1, имеет размер 23403 п.н. и содержит 7 экзонов. Продукт этого гена регулирует клеточные процессы пролиферации, дифференцировки, адгезии, апоптоза, миграции, воспаления, фиброза, заживления ран и ангиогенеза [16]. Рецепторы к TGFB1 расположены на многих клетках, поэтому данный пептид является одним из основных регуляторов экспрессии других ростовых факторов, выступая в роли как стимулирующего, так и ингибирующего фактора. По отношению к иммунным клеткам ведет себя, как иммуносупрессорный фактор. Полиморфный вариант Т локуса TGFB1 -509С>T (rs1800469) содержит замену цитозина на тионин и приводит к повышению уровня экспрессии этого цитокина [17]. По-видимому, высокая экспрессия TGF-ß1 способствует своевременной остановке воспалительного процесса и не дает ему перейти в разряд патологических на поздних стадиях заболевания.

Полученные нами данные позволяют рассматривать генетическую предрасположенность к пониженной экспрессии TNF и TGFB1 как факторы риска развития вагинита. Факторы риска развития вагинитов ассоциированы с “дикими” и более распространенными в популяции аллелями, что возможно и обуславливает широкое распространение данной гинекологической патологии.

Таким образом, при вагинитах установлена положительная ассоциация аллеля С локуса TGFB1 -509 C>T (OR=1,8 (CI: 1,1-2,9) по аутосомно-рецессивному типу. Аллель А локуса TNF –238 G>A является протективным в отношении вагинитов по аутосомно-доминантному типу (OR=0,21 (CI: 0,07-0,68)).

References

  1. Farage M.A., Stadler A. Risk factors for recurrent vulvovaginal candidiasis. Am. J. Obstet. Gynecol. 2005; 192(3): 981–2; author reply 982-3.
  2. Workowski K.A., Berman S.; Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Sexually transmitted diseases treatment guidelines, 2010. MMWR Recomm. Rep. 2010; 59(RR-12): 1–110.
  3. Ankirskaya A.S. Nonspecific vaginitis. Gynekolog. 2005; 4: 15-8. (in Russian)
  4. Serov V.N. Especially infections in obstetrics, gynecology and perinatology. RMJ. 2006; 14 (1): 2-5. (in Russian)
  5. Johnson M.D., Plantinga T.S., van de Vosse E., Velez Edwards D.R., Smith P.B., Alexander B.D. et al. Cytokine gene polymorphisms and the outcome of invasive candidiasis: a prospective cohort study. Clin. Infect. Dis. 2012; 54(4): 502–10.
  6. Cauci S., Di Santolo M., Casabellata G., Ryckman K., Williams S.M., Guaschino S. Association of interleukin-1 beta and interleukin-1 receptor antagonist polymorphisms with bacterial vaginosis in non-pregnant Italian women. Mol. Hum. Reprod. 2007; 13(4): 243–50.
  7. Genc M.R., Vardhana S., Delaney M.L., Onderdonk A., Tuomala R., Norwitz E., Witkin S.S. Relationship between a toll-like receptor-4 gene polymorphism, bacterial vaginosis-related flora and vaginal cytokine responses in pregnant women. Eur. J. Obstet. Gynecol. Reprod. Biol. 2004; 116(2): 152–6.
  8. Goepfert A.R., Varner M., Ward K., Macpherson C., Klebanoff M., Goldenberg R.L. et al. Differences in inflammatory cytokine and Toll-like receptor genes and bacterial vaginosis in pregnancy. Am. J. Obstet. Gynecol. 2005; 193(4): 1478–85.
  9. Gomez L.M., Sammel M.D., Appleby D.H., Elovitz M.A., Baldwin D.A., Jeffcoat M.K. et al. Evidence of a gene-environment interaction that predisposes to spontaneous preterm birth: a role for asymptomatic bacterial vaginosis and DNA variants in genes that control the inflammatory response. Am. J. Obstet. Gynecol. 2010; 202(4): 381–6.
  10. Rey G., Skowronek F., Alciaturi J., Alonso J., Bertoni B., Sapiro R. Toll receptor 4 Asp299Gly polymorphism and its association with preterm birth and premature rupture of membranes in a South American population. Mol. Hum. Reprod. 2008; 14(9): 555–9.
  11. Higuchi R. Simple and rapid preparation of samples for PCR. In: Erlich H, ed. PCR technology: Principles and applications for DNA amplification. New York: Stockton Press; 1989: 31–8.
  12. Abecasis G.R., Altshuler D., Auton A., Brooks L.D., Durbin R.M., Gibbs R.A., Hurles M.E., McVean G.A. A map of human genome variation from population-scale sequencing. Nature. 2010; 467(7319): 1061–73.
  13. Mills R.E., Walter K., Stewart C., Handsaker R.E., Chen K., Alkan C. et al. Mapping copy number variation by population-scale genome sequencing. Nature. 2011; 470(7332): 59–65.
  14. Bidwell J., Keen L., Gallagher G., Kimberly R., Huizinga T., McDermott M.F. et al. Cytokine gene polymorphism in human disease: on-line databases. Genes Immun.1999; 1(1): 3–19.
  15. Liu С., Wang J., Zhou S., Wang B., Ma X. Association between -238 but not -308 polymorphism of Tumor necrosis factor alpha (TNF-alpha) and unexplained recurrent spontaneous abortion (URSA) in Chinese population. Reprod. Biol. Endocrinol. 2010; 8: 114.
  16. Massague J., Gomis R.R. The logic of TGFbeta signaling. FEBS Lett. 2006; 580: 2811–20.
  17. Grainger D.J., Heathcote K., Chiano M., Snieder H., Kemp P.R., Metcalfe J.C. et al. Genetic control of the circulating concentration of transforming growth factor type beta1. Hum. Mol. Genet. 1999; 8: 93–7.

About the Authors

Bayramova Guldana, MD, Clinic supervisor, Academician V.I. Kulakov Research Centre of Obstetrics, Gynecology and Perinatology, Ministry of Health of Russia.
117997, Russia, Moscow, Ac. Oparina str. 4. Tel.: +74954381866. E-mail: bayramova@mail.ru
Bourmenskaya O.V., Ph.D., researcher of the laboratory of molecular genetic methods, Academician V.I. Kulakov Research Centre of Obstetrics,
Gynecology and Perinatology, Ministry of Health of Russia. 117997, Russia, Moscow, Ac. Oparina str. 4. Tel.: +74954382292. E-mail: bourmenska@mail.ru
Kadochnikova V.V., PhD, researcher, Laboratory of Human Histocompability Genetics, State Research Center Institute of Immunology, Federal Biomedical
Agency of Russia. 115478, Russia, Moscow, Kashirskoye sh. 24 bld. 2. Tel.: +79163782847. E-mail: vladavi@mail.ru
Prilepskaya V.N., MD, Professor, Deputy Director for Science, Academician V.I. Kulakov Research Centre of Obstetrics, Gynecology and Perinatology,
Ministry of Health of Russia. 117997, Russia, Moscow, Ac. Oparina str. 4. Tel.: +74954386934. Е-mail: VPrilepskaya@mail.ru
Trofimov D.Yu., DSc, Head of laboratory of molecular genetic methods, Academician V.I. Kulakov Research Centre of Obstetrics, Gynecology and Perinatology,
Ministry of Health of Russia. 117997, Russia, Moscow, Ac. Oparina str. 4. Tel.: +74954384951. Е-mail: d_trofimov@oparina4.ru

Similar Articles

By continuing to use our site, you consent to the processing of cookies that ensure the proper functioning of the site.