Determination of free embryonic DNA in the plasma of pregnant women for noninvasive prenatal genetic diagnosis

Tetruashvili N.K., Fedorova N.I., Faizullin L.Z., Karnaukhov V.N.

Academician V. I. Kulakov Research Center of Obstetrics, Gynecology, and Perinatology, Ministry of Health of Russia, Moscow
Recurrent miscarriage is a polyetiological problem requiring examination and preparation before planned pregnancy.
The paper gives an improved examination program for non-pregnant patients and describes the causal factors of recurrent miscarriage in 230 married couples.
It also outlines the results of a randomized trial evaluating the efficacy of actovegin incorporated into a pregestational preparation program for women with recurrent miscarriage and chronic endometritis.

Keywords

pregestational preparation
actovegin
recurrent miscarriage

Необходимость своевременной постановки диагноза с минимальным риском для матери и плода определяет актуальность разработки и внедрения методов неинвазивной пренатальной диагностики. Инвазивные методы пренатальной диагностики, обладая высокой информативностью, тем не менее повышают риск прерывания беременности, особенно у женщин с осложненным течением гестационного процесса. Согласно данным английских авторов, за период 2002–2003 гг.всвязисразличнымипоказаниями у 30 тыс. женщин проведена процедура амниоцентеза, у 8 тыс. – хориоцентеза, что привело к самопроизвольному прерыванию 460 желанных беременностей с нормальным кариотипом плода [16]. При выполнении этих процедур даже опытными специалистами риск потери беременности составляет около 1–2% [15]. С целью ранней постановки генетического диагноза и снижения риска самопроизвольного прерывания беременности в различных лабораториях проводились поиски неинвазивных методов пренатальной диагностики.

Еще в 1893 г. G. Schmorl впервые высказал предположение, что клетки плодового происхождения
могут проникать в кровь матери [36]. Эта гипотеза основывалась на обнаружении клеток плацентарного происхождения в легочной ткани женщин, умерших от эклампсии. Только во второй половине ХХ века эти клетки начали активно использовать для выявления анеуплоидии и хромосомных
аберраций у плода. Однако это направление не получило широкого распространения в связи с
тем, что эмбриональных клеток в кровотоке матери мало (1–6 на мл крови) и они продолжают циркулировать в крови женщины многие годы и после окончания беременности, что может приводить к ложно-позитивным результатам при последующих беременностях [4].

Выявление в 1997 г. свободной (внеклеточной) эмбриональной ДНК (сэ-ДНК), циркулирующей в плазме крови матери, открыло новые возможности неинвазивной пренатальной генетической диагностики плода во время беременности [27]. При физиологической беременности от 3 до 6% всей свободной ДНК в материнской плазме имеет эмбриональное происхождение. Она может быть обнаружена уже на 4–5 нед беременности и ее количество нарастает до родов [28]. В отличие от эмбриональных клеток сэ-ДНК быстро исчезает из материнской плазмы после родов. Сэ-ДНК имеет период полужизни 16 мин и не определяется уже через 2 ч после родоразрешения, что указывает на ее специфичность конкретно для данной беременности.

Имеются убедительные доказательства тому, что сэ-ДНК имеет плацентарное происхождение
и поступает в кровь беременной вследствие плацентарного апоптоза [22, 23, 32]. В пользу этого
говорят результаты исследований, согласно которым сэ-ДНК выявляется еще до установления фетоплацентарного кровотока [35], а также при анэмбрионии [1]. Более того, проведение лазерной аблации анастамозов в плаценте сопровождается увеличением концентрации сэ-ДНК в кровотоке беременной [40]. Согласно результатам другого исследования, отцовский аллель, присутствующий в плаценте с подтвержденным генетическим мозаицизмом, выявлялся в материнской плазме, но отсутствовал у новорожденного, что также свидетельствует о плацентарном происхождении сэ-ДНК [29].

В связи с этим логично предположить, что различные нарушения состояния плаценты будут сопровождаться повышенным выбросом сэ-ДНК в кровоток матери. Действительно, было показано, что такие нарушения плацентации, как предлежание плаценты или различные формы врастания ее в миометрий сопровождаются значительным повышением концентрации сэ-ДНК в плазме беременной [8, 30, 38].

В связи с тем что сэ-ДНК в кровотоке беременной присутствует вместе с материнской внеклеточной ДНК, применение ее для клинической диагностики на сегодняшний день имеет определенные ограничения. Основное отличие между этими фракциями в том, что сэ-ДНК на 90% представлена в виде апоптотических фрагментов длиной до 200 пар нуклеотидов, тогда как материнская ДНК более длинная и может быть результатом как апоптоза, так и некроза [5, 11]. Современные технологии не позволяют пока эффективно разделять эти фракции.

Наиболее достоверным способом идентификации сэ-ДНК в настоящее время является выявление в плазме генов Y-хромосомы у женщин, вынашивающих плоды мужского пола. В нескольких лабораториях были разработаны методы пренатального определения пола плода с помощью технологии полимеразной цепной реакции в реальном времени с праймерами для генов Y-хромосомы SRY (sex-determining region Y) и TSPY (testis-specific protein, Y-linked) или DYS-14 [34, 17]. Ген SRY представлен в геноме в одной копии и позволяет с 95% эффективностью идентифицировать пол плода после 10 нед гестации [17, 34, 10]. Более высокая эффективность выявления ДНК Y-хромосомы в плазме матери достигается при амплификации многокопийного (от 15 до 35 копий) гена TSPY. По данным британских исследователей, выявление этого гена позволяет достигнуть точности определения пола плода в 97,6 % в сроках 6–7 нед беременности [18].

Определение пола плода приобретает клиническую значимость в случаях сцепленных с половыми хромосомами наследственных заболеваний, таких как гемофилия, миодистрофия Дюшенна, Х-сцепленная задержка умственного развития, адренолейкодистрофия, Х-сцепленный тяжелый
иммунодефицит, Х-сцепленная гидроцефалия, и других [6, 19, 7, 41]. Установление пола плода
также важно в случаях, когда наружные половые органы плода развиты нетипично и при ряде эндокринных нарушений, как, например, врожденная гиперплазия коры надпочечников, сопровождающаяся вирилизацией плода женского пола, что требует антенатального лечения
[7]. Кроме того, на сегодняшний день имеются убедительные данные в отношении особенностей течения беременности в зависимости от пола плода. У беременных, вынашивающих плод мужского пола, в 1,5–2 раза повышен риск как ранних, так и поздних гестационных потерь, преэклампсии, что требует тщательного мониторинга во время беременности [8, 30, 38].

Из аутосомно-наследуемых генов в ряде зарубежных клиник хорошо разработана и внедрена в качестве лабораторной диагностики пренатальная диагностика резус-D гена плода путем исследования сэ-ДНК в плазме крови матери [21]. Методика определения резус-принадлежности плода по крови матери и пренатальное определение пола плода практически схожи. В европейской популяции резус-отрицательный фенотип обусловлен полным отсутствием в геноме локуса резус-антигена, поэтому выявление в крови резус-отрицательной беременной этой ДНК будет однозначно указывать на резус-положительную кровь плода.

Иммунологическая несовместимость плода и матери по резус-фактору является основной причиной гемолитической болезни новорожденного [2]. До 95% всех клинически значимых случаев гемолитической болезни плода обусловлены несовместимостью по резус-фактору. Для предотвращения резус-сенсибилизации матери используют анти-резус иммуноглобулины. В настоящее время в мире принята тактика введения анти-резус иммуноглобулинов всем резус-отрицательным женщинам при резусположительной крови супруга с 28-й по 34-ю нед беременности [33], что позволяет снизить
риск иммунизации на 80%. В то же время при наличии резус-отрицательного плода эта профилактическая мера, связанная с введением белкового препарата (анти-Rhо(D) иммуноглобулина), является бесполезным, небезопасным и дорогостоящим мероприятием [12]. В связи с этим пренатальное определение резус-фактора плода неинвазивным методом позволит избежать ненужного медикаментозного воздействия при наличии резус-отрицательного плода и назначать профилактическое введение анти-Rhо(D) иммуноглобулина только при положительной резусринадлежности плода. Исследования, проведенные во многих лабораториях, показали, что применение полимеразной цепной реакции для выявления резус-D гена плода в материнской плазме крови после 15 нед гестации позволяет устанавливать резус-принадлежность плода со 100% увствительностью и 90–95% специфичностью [3, 13]. В 5–10% случаев возможно получение ложно-положительного результата в связи с наличием в европейской популяции азиатского или африканского генотипа резус-фактора, характеризующегося наличием дефектного гена RhD, проявляющегося как резус-отрицательный фенотип [2]. Внедрение в широкую практику определения резус-фактора плода по крови матери снизит число беременных, которым потребуется антенатальная профилактика анти-резус иммуноглобулином.

Нарушения роста и развития плаценты во время беременности находят отражение в повышении уровней свободной ДНК эмбрионального происхождения, что было доказано при различных осложнениях беременности [14, 43]. Осложнения, ассоциированные с плацентарной дисфункцией, такие как угроза выкидыша, задержка роста плода, преэклампсия сопровождаются развитием ишемии плацентарных сосудов, апоптозом трофобластических клеток и высвобождением эмбриональной ДНК в плазму крови беременной до концентраций значительно (в 3 и более раз) превышающих таковую при нормальном течении беременности [22]. При этом было отмечено, что превышение нормального
уровня сэ-ДНК возникает значительно раньше появления клинических признаков патологии беременности [24, 42].

Повышение уровней свободной ДНК эмбрионального происхождения у беременных с преэклампсией было впервые продемонстрировано в 1999 г. D. Lo и соавт. [25]. В дальнейшем было показано, что еще за 1–2 нед до появления симптомов преэклампсии уровень сэ-ДНК повышается в 2–3 раза, а при появлении клинической симптоматики – в 2–14 раз [21, 37].

Кроме преэклампсии были описаны и другие акушерские осложнения, при которых имеет место повышение уровня свободной ДНК эмбрионального происхождения: преждевременные роды, тяжелая рвота беременных, плотное прикрепление плаценты или ее врастание, задержка роста плода, внутриматочные гематомы, многоводие [41, 21].

Анеуплоидии–числовыеизмененияхромосом, часто являются следствием нарушений в процессе мейоза при образовании гамет. Большинство этих нарушений приводят к физическим аномалиям, нарушению умственного развития и бесплодию. «Золотым стандартом» диагностики любой анеуплоидии является исследование кариотипа клеток плодового происхождения, полученных при помощи хориоцентеза или
амниоцентеза [31].

В связи с риском инвазивных методов для беременности в настоящее время во многих лабораториях ведутся разработки методов для установления хромосомных аберраций путем исследования сэ-ДНК в материнской крови. Основная трудность этих работ заключается в идентификации эмбриональной ДНК, составляющей 3–6% от всей свободной ДНК в плазме крови.

D. Lo и соавт. для дифференциации эмбриональной ДНК использовали различие в характере метилирования определенных участков эмбриональной и материнской ДНК [39]. Такой подход позволил идентифицировать трисомию по 18 и 21 хромосомам с чувствительностью, близкой к 100%, и специфичностью до 95%. В этой же лаборатории был предложен другой метод идентификации эмбриональной ДНК и выявления аутосомальной анеуплоидии у эмбриона, основанный на определении специфических для хромосомы однонуклеотидных полиморфизмов [26]. Чувствительность такой диагностики может быть значительно повышена при использовании формальдегида для стабилизации клеток в материнской крови и увеличения доли эмбриональной ДНК в плазме [9].

В плазме крови беременной кроме эмбриональной ДНК выявляются свободные эмбриональные мРНК и микроРНК, которые также определяются на самых ранних сроках беременности и исчезают из кровотока сразу после родоразрешения, период их полужизни составляет 15–20 мин [20, 41]. Так как экспрессия определенных генов является уникальной во время беременности, определение плацентарной/эмбриональной РНК является многообещающим методом исследования с возможностью более эффективной дифференциации эмбриональной РНК от материнской.

Таким образом, свободные нуклеиновые кислоты, присутствующие в материнском кровотоке во время беременности, могут быть использованы для ранней неинвазивной пренатальной диагностики генетического статуса плода.

Существуют перспективы клинического использования определения свободной ДНК эмбрионального происхождения, основанные на отчетливых различиях материнской и эмбриональной ДНК:
1. Прогнозирование осложнений беременности по повышению абсолютного уровня сэ-ДНК.
2. Диагностика резус-фактора плода по резус-D гену у резус-отрицательных беременных женщин.
3. Установление пола плода путем определения свободных последовательностей ДНК, локализованных на Y-хромосоме.
4. Диагностика генных и хромосомных мутаций плода.
Требуются дальнейшие исследования в данной области для определения возможностей клинического применения описанных методов, как у беременных женщин групп риска, так и в качестве скрининговых методик.

References

1. Alberry M., Maddocks D., Jones M. et al. Free fetal DNA in maternal plasma in anembryonic pregnancies: confirmation that the origin is the trophoblasts // Prenat. Diagn. – 2007. – Vol. 27. – P. 415 – 418.
2. Avent N.D., Reid M.E. The Rh blood group system: a review // Blood. – 2000. – Vol. 95. – P. 375 – 387.
3. Avent N.D. RhD genotyping from maternal plasma: guidelines and technical challenges // Methods Mol. Biol. – 2008. – Vol. 444. – P. 185 – 201.
4. Bianchi D.W., Zickwolf G.K., Weil G.J et al. Male fetal progenitor cells persistin maternal blood for as long as 27 years postpartum // Proc Nat. Acad Sci USA. – 1996. – Vol. 93. – P. 705 – 708.
5. Chan K.C.A., Zhang J., Hui A.B. et al. Size distributions of maternal and fetal DNA in maternal plasma // Clin. Chem. – 2004. – Vol. 50. – P. 88 – 92.
6. Costa J.M., Benachi A., Gautier E. New strategy for prenatal diagnosis of X-linked disorders // N Engl J Med. – 2002. – Vol. 346. – P. 1502.
7. Chiu R.W.K., Lau T.K., Cheung P.T. et al. Noninvasive prenatal exclusion of congenital adrenal hyperplasia by maternal plasma analysis: a feasibility study // Clin. Chem. – 2002. – Vol. 48. – P. 778 – 780.
8. Di Renzo G.C., Rosati A., Sarti R.D. et al. Does fetal sex affect pregnancy outcome? // Gend. Med. – 2007. – Vol. 4. – P. 19 – 30.
9. Dhallan R., Guo X., Emche S. et al. A non-invasive test for prenatal diagnosis based on fetal DNA present in maternal blood: a preliminary study // Lancet. – 2007. – Vol. 10. – P. 474 – 481.
10. Finning K.M., Chitty L.S. Non-invasive fetal sex determination: impact on clinical practice // Semin. Fetal. Neonatal Med. – 2008. – Vol.13. – P. 69 – 75.
11. Fan H.C., Blumenfeld Y.J., Chitkara U. et al. Analysis of the Size Distributions of Fetal and Maternal Cell-Free DNA by Paired-End Sequencing // Clin. Chem. – 2010. – Vol. 5. – P. 1279 – 1286.
12. Finning K., Martin P., Summers J. et al. Effect of high throughput RhD typing of fetal DNA in maternal plasma on use of anti-RhD immunoglobulin in RhD negative pregnant women: prospective feasibility study // BMJ. – 2008. – Vol. 12. – P. 816-818.
13. Finning K., Martin P., Daniels G. The use of maternal plasma for prenatal RhD blood group genotyping // Methods Mol. Biol. – 2009. – Vol. 49. – P. 143 – 157.
14. Farina A., Sekizawa A., Rizzo N. et al. Cell-free fetal DNA (SRY locus) concentration in maternal plasma is directly correlated to the time elapsed from the onset of PET to the collection of blood // Prenat. Diagn. – 2004. – Vol. 24. – P. 293 – 297.
15. Geifman-Holtzman O., Ober Berman J. Prenatal diagnosis: update on invasive versus noninvasive fetal diagnostic testing from maternal blood // Expert Rev Mol. Diagn. – 2008. – Vol. 8, N 6. – P. 727 – 751.
16. Human Genetics Commission. Choosing the future: genetics and reproductive decision making. July 2004.
17. Hill M., Finning K., Martin P. et al. Non-invasive prenatal determination of fetal sex: translating research into clinical practice // Clin. Genet. – 2010. – Aug 19.
18. Hill M., Taffinder S., Chitty L.S. et al. Incremental cost of non-invasive prenatal diagnosis versus invasive prenatal diagnosis of fetal sex in England // Prenat. Diagn. – 2011. – Vol. 31, N 3. – P. 267 – 255.
19. Hall A., Bostanci A., Wright C.F. Non-invasive prenatal diagnosis using cell-free fetal DNA technology: applications and implications // Public Health Genomics. – 2010. – Vol. 13, N 4. – P. 246 – 255.
20. Hung E.C., Chiu R.W., Lo Y.M. Detection of circulating fetal nucleic acids: a review of methods and applications // J. Clin. Pathol. – 2009. – Vol. 62, N 4. – P. 308 – 313.
21. Illanes S., Parra M., Serra R. et al. Increased free fetal DNA levels in early pregnancy plasma of women who subsequently develop preeclampsia and intrauterine growth restriction // Prenat. Diagn. – 2009. – Vol. 29, N 12. – P. 1118 – 1122.
22. Ishihara N., Matsuo H., Murakoshi H. et al. Increased apoptosis in the syncytiotrophoblast in human term placentas complicated by either PET or intrauterine growth retardation // Am. J Obstet. Gynecol . – 2002 . – Vol. 86, N 1. – P. 158 – 166.
23. Leung T.N., Lau T.K., Chung T.K. Thalassaemia screening in pregnancy // Curr Opin Obstet. Gynecol. – 2005. – Vol. 17, N 2. – P. 129 – 134.
24. Leung T.N., Zhang J., Lau T.K. et al. Increased maternal plasma fetal DNA concentrations in women who eventually develop PET // Clin. Chem. – 2001. – Vol. 47. – P. 137 – 139.
25. Lo Y.M., Leung T.N,, Tein M.S. et al. Quantitative abnormalities of fetal DNA in maternal serum in preeclampsia // Clin. Chem. – 1999. – Vol. 45, N 2. – P. 184 – 188.
26. Lo Y.M. Noninvasive prenatal detection of fetal chromosomal aneuploidies by maternal plasma nucleic acid analysis: a review of the current state of the art // BJOG. – 2009. – Vol. 116, N 2. – P. 152 – 157.
27. Lo Y.M.D., Corbetta N., Chamberlain P.F. et al. Presence of fetal DNA in maternal plasma and serum // Lancet. – 1997 – Vol. 350. – P. 485 – 487.
28. Lo Y.M.D., Tein M.S., Lau T.K. et al. Quantitative analysis of fetal DNA in maternal plasma and serum: implications for noninvasive prenatal diagnosis // Am. J Hum. Genet. – 1998. – Vol. 62. – P. 768 – 775.
29. Masuzaki H., Miura K., Yoshiura K. et al. Detection of cell free placental DNA in maternal plasma: direct evidence from three cases of confined placental mosaicism // J Med. Genet. – 2004. – Vol. 41. – P. 289 – 292.
30. Melamed N., Yogev Y., Glezerman M. Fetal gender and pregnancy outcome // J Matern. Fetal. Neonatal Med. – 2010. – Vol. 23, N 4. – P. 338 – 344.
31. Mujezinovic F., Alfirevic Z. Procedure-related complications of amniocentesis and chorionic villous sampling: a systematic review // Obstet. Gynecol. – 2007. – Vol. 110, N 3. – P. 687 – 694.
32. Masuzaki H., Miura K., Yoshiura et al. Detection of cell free placental DNA in maternal plasma: direct evidence from three cases of confined placental mosaicism // J Med. Genet. – 2004. – Vol. 41. – P. 289 – 292.
33. Pilgrim H., Lloyd-Jones M., Rees A. Routine antenatal anti-D prophylaxis for RhD-negative women: a systematic review and economic evaluation // Health Techno.l Assess. – 2009. – Vol.13, N 10. – P. 100 – 103.
34. Ren C.C., Miao X.H., Cheng H. et al. Detection of fetal sex in the peripheral blood of pregnant women // Fetal. Diagn. Ther. – 2007. – Vol. 22, N 5. – P. 377 – 382.
35. Rijnders R.J., van der Luijt R.B., Peters E.D. et al. Earliest gestational age for fetal sexing in cell-free maternal plasma // Prenat. Diagn. – 2003. – Vol. 23. – P. 1042 – 1044.
36. Schmorl G. Pathologische-anatomische Untersuchungen uber Puerperal-Eklampsie. Leipzig: Vogel 1893.
37. Sifakis S., Zaravinos A., Maiz N. et al. First-trimester maternal plasma cell-free fetal DNA and preeclampsia // Am. J Obstet. Gynecol. – 2009. – Vol. 201, N 5. – P. 472 – 477.
38. Timmerman E., Pajkrt E., Bilardo C.M. Male gender as a favorable prognostic factor in pregnancies with enlarged nuchal translucency // Ultrasound Obstet. Gynecol. – 2009. – Vol. 34, N 4. – P. 373 – 378.
39. Tong Y.K., Chiu R.W., Leung T.Y. et al. Detection of restriction enzyme-digested target DNA by PCR amplification using a stem-loop primer: application to the detection of hypomethylated fetal DNA in maternal plasma // Clin. Chem. – 2007. – Vol. 53, N 11. – P. 1906 – 1914.
40. Wataganara T., Gratacos E., Jani J. et al. Persistent elevation of cell-free fetal DNA levels in maternal plasma after selective laser coagulation of chorionic plate anastomoses in severe midgestational twintwin transfusion syndrome // Am. J Obstet. Gynecol. – 2005. – Vol. 192. – P. 604 – 609.
41. Wright C.F., Burton H. The use of cell-free fetal nucleic acids in maternal blood for non-invasive prenatal diagnosis // Hum. Reprod. Update. – 2009. – Vol. 5, N 1. – P. 139 – 151.
42. Zhong X.Y., Holzgreve W., Hahn S. The levels of circulatory cell free fetal DNA in maternal plasma are elevated prior to the onset of PET // Hypertens Pregnancy. – 2002. – Vol. 21. – P. 77 – 83.
43. Zhong X.Y., Laivuori H., Livingston J.C. et al. Elevation of both maternal and fetal extracellular circulating deoxyribonucleic acid concentrations in the plasma of pregnant women with PET // Am. J Obstet. Gynecol. – 2001. – Vol. 184. – P. 414 – 419.

About the Authors

Professor Tetruashvili Nana Kartlosovna, MD, Head, Second Obstetric Department of Pregnancy Pathology, Academician V. I. Kulakov Research Center of Obstetrics, Gynecology, and Perinatology, Ministry of Health and Social Development of Russia
Address: 4, Academician Oparin St., Moscow 117997, Russia
Telephone: 8 (916) 600-30-15
E-mail: tetrauly@mail.ru

Fedorova Natalya Igorevna, Physician, Second Obstetric Department of Pregnancy Pathology, Academician V. I. Kulakov Research Center of Obstetrics, Gynecology, and Perinatology, Ministry of Health and Social Development of Russia
Tel.: 8 (916) 353-99-33.
E-mail: natasha_fedorova@mail.ru

Faizullin Leonid Zakiyevich, Candidate of Biological Sciences, Leading Researcher, Laboratory of Molecular Genetic Methods, Academician V. I. Kulakov Research Center of Obstetrics, Gynecology, and Perinatology, Ministry of Health and Social Development of Russia
Telephone: 8(916) 710-67-89
E-mail: lfaizullin@mail.ru

Karnaukhov Vitaly Nikolayevich, Junior Researcher, Laboratory of Molecular Genetic Methods, Academician V. I. Kulakov Research Center of Obstetrics, Gynecology, and Perinatology, Ministry of Health and Social Development of Russia
Telephone: (916) 213-49-26

Similar Articles

By continuing to use our site, you consent to the processing of cookies that ensure the proper functioning of the site.