The expression level of long non-coding RNAs ROR and MALAT1 in endometriosis

Levakov S.A., Mamedova A.E., Azadova G.Ya., Paukov S.V., Maslyakova M.I., Pavlyukov M.S., Shakhparonov M.I., Antipova N.V.

1) Department of Obstetrics and Gynecology, Department of General Medicine, I.M. Sechenov First Moscow State Medical University (Sechenov University), Ministry of Health of Russia, Moscow, Russia; 2) Academicians M.M. Shemyakin and Yu.A. Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Sciences, Moscow, Russia; 3) National Research University “Higher School of Economics”, Moscow, Russia
Objective. To estimate the expression level of long non-coding RNAs ROR and MALAT1 in the endometriosis-affected ovarian tissue biopsy specimens relative to the control group.
Materials and methods. The endometrioid ovarian cyst and endometriosis-unaffected ovarian tissue samples from 20 reproductive-aged women were examined. The expression of long non-coding RNAs ROR and MALAT1 was analyzed by real-time PCR using primers that were specific to these genes.
Resu1ts. There was a substantial decrease in the expression level of long non-coding RNA ROR and an increase in the expression of MALAT1 in the endometriosis-affected tissue samples relative to the control group.
Conclusion. The investigation revealed a relationship between the decreased level of lncROR expression, the increased level of MALAT1, and the presence of ovarian endometriosis. The findings suggest that long non-coding RNAs play a possible role in the development of proliferative processes in ovarian endometriosis and correlate with the data obtained from the analysis of uterine myoma samples. Further investigations may determine the clinical potential of long non-coding RNAs in the diagnosis and treatment of proliferative diseases of the female reproductive system, in particular precancerous ovarian lesions.

Keywords

endometriosis
long non-coding RNAs
lncROR
MALAT1

Эндометриоз является хроническим, эстроген-зависимым, прогрессирующим заболеванием и характеризуется наличием эндометриоидной ткани, желез и стромы вне полости матки [1]. Чаще всего поражаются яичники, маточные трубы и тазовая брюшина. Это заболевание связано с имплантацией эндометриоидно-подобных клеток, сопровождающейся их повышенной пролиферацией и миграцией. Эндометриоз – одна из ведущих причин заболеваемости женщин в фертильном возрасте и во время пременопаузы [2]; оно может привести к самопроизвольному прерыванию беременности и бесплодию в 50% случаев [3]. Золотым стандартом диагностики эндометриоза являются лапароскопия и гистологическое исследование хирургического образца [4]. Наиболее распространенными причинами эндометриоза являются ретроградная менструация, генетическая предрасположенность, лимфогенное распространение, иммунная дисфункция, метаплазия, а также экологические причины. Помимо значительных отрицательных эффектов, касающихся здоровья и благополучия женщин, нельзя игнорировать риск развития эндометриоз-ассоциированного рака яичников [5, 6].

Длинные некодирующие РНК (днРНК) являются большой группой некодирующих РНК длиной более 200 нуклеотидов [7]. ДнРНК, как факторы регуляции, играют важную роль в сложных клеточных процессах: апоптозе, росте, дифференцировке, пролиферации и т.д. Циркулирующие днРНК представляют собой перспективные биомаркеры при различных заболеваниях, включая эндомет­риоз [8]. Накапливающиеся данные показывают, что днРНК связаны с инициацией и развитием многих типов рака и могут функционировать как онкогены или супрессоры опухолей [9, 10]. По этой причине количество некоторых днРНК сильно изменено в клетках опухолей по сравнению с нормальными тканями.

Ранее было показано, что при эндометриозе яичников наблюдается повышенный уровень аутофагии; этот процесс регулируется днРНК MALAT1 (metastasis associated lung adenocarcinoma transcript 1) и может способствовать выживанию эндометриоидных клеток в эктопических участках и поддержанию поражения эндометрия [11]. Изучение роли днРНК при эндометриозе открывает путь для создания новых диагностических тестов и определения новых терапевтических мишеней [12].

Длинная некодирующая РНК ROR (regulator of reprogramming), по литературным данным, влияет на возникновение и развитие опухолей человека, включая рак груди, колоректальный рак, рак поджелудочной железы, гепатоцеллюлярную карциному и другие [9, 13]. Нарушение регуляции lncROR тесно связано с клинико-патологическими факторами, указывающими на неблагоприятный прогноз.

Важно отметить, что основным патологическим механизмом возникновения таких заболеваний, как эндометриоз, является эпителиально-мезенхимальный переход (ЭМП), для которого показана связь с изменением экспрессии днРНК MALAT1 и ROR [9, 14]. Таким образом, выяснение роли днРНК в нормальных и патологических клетках крайне важно.

Цель исследования: оценить уровень экспрессии длинных некодирующих РНК ROR и MALAT1 в биоптатах ткани яичников, пораженной эндометриозом, относительно группы контроля.

Материалы и методы

В исследовании принимали участие 20 пациенток, которые были разделены на 4 группы: 1-я группа – пациентки с эндометриоидными кистами яичников и гиперплазией эндометрия (n=5); 2-я группа – пациентки с изолированными эндометриоидными кистами яичников (n=5); 3-я группа – пациентки с сочетанием эндометриоидных кист яичников и аденомиоза/миомы матки (n=5); 4-я группа – конт­рольная (n=5). Критерии включения в исследование для 1-й группы: общие требования – женщины репродуктивного возраста (от 18 до 45 лет); для 2-й группы – пациентки с установленным диагнозом эндометриоза яичников; для 3-й группы – пациентки с установленным диагнозом эндометриоза яичников в сочетании с аденомиозом и/или миомой матки.

К критериям невключения относили: ювенильный, перименопаузальный и постменопаузальный возрастные периоды (младше 18 лет и старше 45 лет), острые воспалительные заболевания, тяжелая экстрагенитальная патология, аутоиммунные заболевания, онкологические заболевания.

В ходе исследования все пациентки предоставляли данные возраста, роста, массы тела. На основании последних двух рассчитывался индекс массы тела (ИМТ) (табл. 1). Исследование было одобрено этическим комитетом ФГАОУ ВО «Первый МГМУ им. И.М. Сеченова» Минздрава России, выписка из протокола №33-20, от 25.11.2020.

На первом этапе молекулярно-генетического исследования проводили оперативное лечение лапароскопическим доступом и удаляли эндометриоидную кисту/кисты яичников. При заборе материала от основного препарата отделяли небольшой участок кисты (0,3–0,5 см) и погружали в стерильную пробирку. В каждый образец добавляли 1 мл тризола с целью ингибирования работы РНКаз, затем гомогенизировали и быстро замораживали при температуре -80˚С. Выделение тотальной мРНК проводилось реагентом ExtractRNA BC032 фирмы «Евроген» по методике производителя, синтез первой цепи кДНК – по протоколу набор MMLV RT SK021 фирмы «Евроген». Уровень экспрессии lncROR и MALAT1 определяли методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с обратной транскрипцией в реальном времени с помощью амплификатора LightCycler 96 Real-Time PCR System (Roche) с использованием праймеров, специфичных для 18S, lncROR и MALAT1 (табл. 2). ПЦР проводили при следующих условиях: предварительная инкубация – 150 с при 95°C; трехшаговая амплификация – 20 с при 95°C, 20 с при 60°C, 20 с при 72°C – 45 циклов; детекция температуры плавления продуктов реакции.

Нормирование образцов кДНК проводилось по контрольному гену рибосомальной 18S РНК. Относительные уровни экспрессии генов lncROR и MALAT1 рассчитывали методом 2-ΔΔCT [15]. Отсутствие побочных продуктов ПЦР определяли по кривой плавления. Для каждой пары праймеров во всех образцах наблюдали одинаковые пики плавления. ПЦР каждого образца в 3 повторах. Полученные значения Ct (cycle threshold) для каждого образца не превышали 35.

Результаты и обсуждение

При анализе транскриптома человека в базе данных TCGA (The Cancer Genome Atlas) для эндометриоза был выявлен увеличенный уровень экспрессии днРНК MALAT1 [11]. В ходе нашей работы методом ПЦР в реальном времени мы также показали повышение уровня экспрессии MALAT1 в группах патологий с эндометриоидными кистами яичников (рис. 1).

143-1.jpg (209 KB)

Важно отметить, что, по нашим результатам, уровень экспрессии MALAT1 различается в паталогических подгруппах, и самый высокий уровень экспрессии наблюдается в группе с сочетанными патологиями эндометриоидной кисты яичника и аденомиоза/миомы матки, возникновение которых тесно связано с ЭМП.

Следующим шагом мы определили уровень экспрессии lncROR (regulator of reprogramming). В отличие от MALAT1, lncROR не полиаденилирована, в связи с чем эта днРНК не детектируется при наиболее частом методе пробоподготовки для РНК секвенирования и, таким образом, отсутствует в базах данных, таких как TCGA. Полученные нами результаты показывают, что экспрессия lncROR более чем в 10 раз понижена во всех исследованных патологиях по сравнению с контрольными образцами. Самый низкий уровень экспрессии lncROR наблюдается в изолированных кистах яичников без сочетанных патологий. В группе с гиперплазией эндометрия уровень экспрессии lncROR выше, а наиболее высокий уровень характерен для группы с сочетанием эндометриоидной кисты яичников и аденомиоза или миомы матки (рис. 2). Таким образом, выбранные нами группы значительно отличаются по представленности данной днРНК.

144-1.jpg (55 KB)Разница между патологическими группами позволяет сделать вывод, что существует механизм регуляции, ответственный за снижение днРНК ROR в клетках доброкачественных новообразований. Известно, что повышенный уровень экспрессии lncROR связан с выживанием в условиях гипоксии и может подавляться miR-145 в опухолевых клетках. Кроме того, было описано участие lncROR в межклеточном взаимодействии благодаря секреции данной днРНК внутри везикул [16, 17].

В работе Chen Yang et al. описана роль днРНК ROR в процессе онкогенеза. LncROR рассматривается как онкоген, влияющий на прогрессирование опухоли, а также как предвестник плохого прогноза для больных раковыми заболеваниями [9]. Таким образом, можно предположить, что заболевания, работа с которыми велась в нашем исследовании, остаются доброкачественными по причине низкого уровня lncROR, а при его повышении возможен переход в злокачественные формы. В соответствии с этим было показано, что уровень экспрессии lncROR повышен при раке яичников [18]. Данное предположение требует дальнейшего изучения и может открыть новые возможности для лечения эндометриоза и предотвращения его развития.

Заключение

В ходе исследования нами было выявлено понижение уровня экспрессии lncROR и повышение уровня экспрессии MALAT1 в образцах ткани с эндометриозом яичников. Полученные результаты свидетельствуют о возможной роли длинных некодирующих РНК в развитии эндометриоза и хорошо совпадают с данными, полученными нами при изучении уровня экспрессии этих днРНК в образцах от пациентов с миомой матки. Таким образом, определение экспрессии длинных некодирующих РНК может играть значимую роль в диагностике эндометриоза яичников. Важно отметить, что, насколько нам известно, уровни lncROR и MALAT1 ранее не сравнивались в группах с сочетанными патологиями, изученными в нашей работе. Требуется проведение дальнейших научных исследований в данном направлении с целью разработки новых прогностических маркеров эндометрий-ассоциированного рака яичников и поиска дополнительных терапевтических мишеней.

References

  1. de Ziegler D., Borghese B., Chapron C. Endometriosis and infertility: pathophysiology and management. Lancet. 2010; 376(9742): 730-8. https://dx.doi.org/10.1016/S0140-6736(10)60490-4.
  2. Baldi A., Campioni M., Signorile P.G. Endometriosis: pathogenesis, diagnosis, therapy and association with cancer (review). Oncol. Rep. 2008; 19(4): 843-6.
  3. Dunselman G.A., Vermeulen N., Becker C., Calhaz-Jorge C., D’Hooghe T., De Bie B. et al. European Society of Human Reproduction Embryology. ESHRE guideline: management of women with endometriosis. Hum. Reprod. 2014; 29(3): 400-12. https://dx.doi.org/10.1093/humrep/det457.
  4. Guerriero S., Condous G., van den Bosch T., Valentin L., Leone F.P., Van Schoubroeck D. et al. Systematic approach to sonographic evaluation of the pelvis in women with suspected endometriosis, including terms, defnitions and measurements: a consensus opinion from the International Deep Endometriosis Analysis (IDEA) group. Ultrasound Obstet. Gynecol. 2016; 48(3): 318-32. https://dx.doi.org/10.1002/uog.15955.
  5. Sofo V., Gotte M., Lagana A.S., Salmeri F.M., Triolo O., Sturlese E. et al. Correlation between dioxin and endometriosis: an epigenetic route to unravel the pathogenesis of the disease. Arch. Gynecol. Obstet. 2015; 292(5): 973-86. https://dx.doi.org/10.1007/s00404-015-3739-5.
  6. Vetvicka V., Kralickova M. Current theories on endometriosis pathogenesis. Edorium J. Mol. Pathol. 2015; 1: 1-4.
  7. Wang M., Yu F., Chen X., Li P., Wang K. The underlying mechanisms of noncoding RNAs in the chemoresistance of hepatocellular carcinoma. Mol. Ther. Nucleic Acids. 2020; 21: 13-27. https://dx.doi.org/10.1016/j.omtn.2020.05.011.
  8. Sun D.E., Ye S.Y. Emerging roles of long noncoding RNA regulator of reprogramming in cancer treatment. Cancer Manag. Res. 2020; 12: 6103-12. https://dx.doi.org/10.2147/CMAR.S253042.
  9. Chen W., Yang J., Fang H., Li L., Sun J. Relevance function of linc-ROR in the pathogenesis of cancer. Front. Cell Dev. Biol. 2020; 8: 696. https://dx.doi.org/10.3389/fcell.2020.00696.
  10. Peng Z., Liu C., Wu M. New insights into long noncoding RNAs and their roles in glioma. Mol. Cancer. 2018; 17: 61. https://dx.doi.org/10.1186/s12943-018-0812-2.
  11. Liu H., Zhang Z., Xiong W., Zhang L., Du Y., Liu Y., Xiong X. Long non-coding RNA MALAT1 mediates hypoxia-induced pro-survival autophagy of endometrial stromal cells in endometriosis. J. Cell. Mol. Med. 2019; 23(1): 439-52. https://dx.doi.org/10.1111/jcmm.13947.
  12. Panir K., Schjenken J.E., Robertson S.A., Hull M.L. Non-coding RNAs in endometriosis: a narrative review. Hum. Reprod. Update. 2018; 24(4): 497-515. https://dx.doi.org/10.1093/humupd/dmy014.
  13. Fei D., Sui G., Lu Y., Tan L., Dongxu Z., Zhang K. The long non-coding RNA-ROR promotes osteosarcoma progression by targeting miR-206. J. Cell. Mol. Med. 2019; 23(3): 1865-72. https://dx.doi.org/10.1111/jcmm.14087.
  14. Du Y., Zhang Z., Xiong W., Li N., Liu H., He H. et al. Estradiol promotes EMT in endometriosis via MALAT1/miR200s sponge function. Reproduction. 2019; 157(2): 179-88. https://dx.doi.org/10.1530/REP-18-0424.
  15. Rao X., Huang X., Zhou Z., Lin X. An improvement of the 2ˆ(-delta delta CT) method for quantitative real-time polymerase chain reaction data analysis. Biostat. Bioinforma Biomath. 2013; 3(3): 71-85.
  16. Dragomir M., Chen B., Calin G.A. Exosomal lncRNAs as new players in cell-to-cell communication. Transl. Cancer Res. 2018; 7(Suppl. 2): S243-52. https://dx.doi.org/10.21037/tcr.2017.10.46.
  17. Takahashi K., Yan I.K., Haga H., Patel T. Modulation of hypoxia-signaling pathways by extracellular linc-RoR. J. Cell Sci. 2014; 127(Pt 7): 1585-94. https://dx.doi.org/10.1242/jcs.141069.
  18. Chen Y., Peng Y., Xu Z., Ge B., Xiang X., Zhang T. et al. LncROR promotes bladder cancer cell proliferation, migration, and epithelial-mesenchymal transition. Cell. Physiol. Biochem. 2017; 41(6): 2399-410. https://dx.doi.org/10.1159/000475910.

Received 29.12.2020

Accepted 02.04.2021

About the Authors

Sergey A. Levakov, MD, Professor, Head of the Department of Obstetrics and Gynecology, Institute of Clinical Medicine named after N.V. Sklifosovsky, I.M. Sechenov First Moscow State Medical University, Ministry of Health of Russia (Sechenov University). Tel.: +7(925)506-31-44. E-mail: levakoff@yandex.ru. ORCID: 0000-0002-4591-838X.
119991, Russia, Moscow, Trubetskaya str., 8-2.
Ainur E. Mamedova, postgraduate student of the Department of Obstetrics and Gynecology, Institute of Clinical Medicine named after N.V. Sklifosovskiy, I.M. Sechenov First Moscow State Medical University, Ministry of Health of Russia (Sechenov University). Tel.: +7(968)400-73-02. E-mail: venesuela93@gmail.com. 0000-0002-9642-4523.
119991, Russia, Moscow, Trubetskaya str., 8-2.
Gyullar Ya. Azadova, postgraduate student of the Department of Obstetrics and Gynecology, Institute of Clinical Medicine named after N.V. Sklifosovsky, I.M. Sechenov
First Moscow State Medical University, Ministry of Health of Russia (Sechenov University). Tel.: +7(985)083-18-08. E-mail: gullyar.azadova@mail.ru.
119991, Russia, Moscow, Trubetskaya str., 8-2.
Sergey V. Paukov, Ph.D., Associate Professor of the Department of Obstetrics and Gynecology, Institute of Clinical Medicine named after N.V. Sklifosovsky, I.M. Sechenov First Moscow State Medical University, Ministry of Health of Russia (Sechenov University). Tel.: +7(985)411-11-66. E-mail: spaukov@mail.ru.
119991, Russia, Moscow, Trubetskaya str., 8-2.
Marina I. Masliakova, student, National Research University «Higher School of Economics». E-mail: marimasmari@gmail.com.
101000, Russia, Moscow, Myasnitskaya str., 20.
Marat S. Pavlyukov, Doctor of Biological Sciences, Senior Researcher of the Laboratory of Membrane and Bioenergetic Systems, Academicians M.M. Shemyakin and
Yu.A. Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Sciences. E-mail: marat.pav@mail.com. 117997, Russia, Moscow, Miklukho-Maklay str., 16/10.
Mikhail I. Shakhparonov, Doctor of Chemistry, Leading Researcher of the Laboratory of Membrane and Bioenergetic Systems, Academicians M.M. Shemyakin and
Yu.A. Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Sciences. E-mail: shakhparonov@gmail.com. ORCID: 0000-0001-5965-8067.
117997, Russia, Moscow, Miklukho-Maklay str., 16/10.
Nadezhda V. Antipova, Ph.D., Senior Researcher of the Laboratory of Membrane and Bioenergetic Systems, Academicians M.M. Shemyakin and Yu.A. Ovchinnikov
Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Sciences. Tel.: +7(977)773-22-07. E-mail: Nadine.antipova@gmail.com. ORCID: 0000-0002-5799-7767.
117997, Russia, Moscow, Miklukho-Maklay str., 16/10

For citation: Levakov S.A., Mamedova A.E., Azadova G.Ya., Paukov S.V., Maslyakova M.I., Pavlyukov M.S., Shakhparonov M.I., Antipova N.V. The expression level of long non-coding RNAs ROR and MALAT1 in endometriosis.
Akusherstvo i Ginekologiya/Obstetrics and Gynecology. 2021; 5: 141-145 (in Russian)
https://dx.doi.org/10.18565/aig.2021.5.141-145

Similar Articles

By continuing to use our site, you consent to the processing of cookies that ensure the proper functioning of the site.