Uterine microbiota and its effect on reproductive outcomes

1. Mascarenhas M.N., Cheung H., Mathers C.D., Stevens G.A. Measuring infertility in populations: constructing a standard definition for use with demographic and reproductive health surveys. Popul. Health Metr. 2012; 10(1): 17.
2. Российская Ассоциация Репродукции Человека. Регистр ВРТ. Отчет за 2016 год. СПб.; 2018. [Russian Association of Human Reproduction. Register of ART. Report for 2016. SPb .; 2018. (in Russian)]
3. Сухих Г.Т., Назаренко Т.А., ред. Бесплодный брак. Современные подходы к диагностике и лечению. Руководство. 2-е изд. М.: ГЭОТАР-Медиа; 2010. [Sukhikh G.T., Nazarenko T.A., ed. Barren marriage. Modern approaches to diagnosis and treatment. Manual. 2nd ed. M .: GEOTAR-Media; 2010. (in Russian)] Available at: http://www.rosmedlib.ru/book/ISBN9785970415351.html
4. Коган Е.А., Калинина Е.А., Колотовкина А.В., Файзулина Н.М., Адамян Л.В. Морфологический и молекулярный субстрат нарушения рецептивности эндометрия у бесплодных пациенток с наружным генитальным эндометриозом. Акушерство и гинекология. 2014; 8: 47-52. [Kogan E.A., Kalinina E.A., Kolotovkina A.V., Fayzulina N.M., Adamyan L.V. Morphological and molecular substrate of endometrial abnormality in infertile patients with external genital endometriosis. Obstetrics and gynecology. 2014; 8: 47-52. (in Russian)]
5. Коган Е.А., Аскольская С.И., Бурыкина П.Н., Файзулина Н.М. Рецептивность эндометрия у женщин с миомой матки. Акушерство и гинекология. 2012; 8-2: 42-8. [Kogan E.A., Askolskaya S.I., Burykina P.N., Fayzulina N.M. Endometrial receptivity in women with uterine myoma. Obstetrics and gynecology. 2012; 8-2: 42-8. (in Russian)]
6. Сафронова Н.А., Калинина Е.А., Донников А.Е., Бурменская О.В., Макарова Н.П., Горшинова В.К. Уровень экспрессии гена кальмодулина в кумулюсных клетках как маркер наличия хромосомных аномалий в эмбрионах в программах экстракорпорального оплодотворения. Акушерство и гинекология. 2016; 10: 64-72. [Safronova N.A., Kalinina E.A., Donnikov A.E., Burmenskaya O.V., Makarova N.P., Gorshinova V.K. The expression level of the calmodulin gene in cumulus cells as a marker for the presence of chromosomal abnormalities in embryos in in vitro fertilization programs. Obstetrics and gynecology. 2016; 10: 64-72. http://dx.doi.org/10.18565/aig.2016.10.64-72. (in Russian)]
7. Кулакова Е.В., Калинина Е.А., Трофимов Д.Ю., Макарова Н.П., Хечумян Л.Р., Дударова А.Х. Вспомогательные репродуктивные технологии у супружеских пар с высоким риском генетических нарушений. Преимплантационный генетический скрининг. Акушерство и гинекология. 2017; 8: 21-7. [Kulakova E.V., Kalinina E.A., Trofimov D.Yu., Makarova NP, Khechumyan L.R., Dudarova A.Kh. Assisted reproductive technologies for couples with a high risk of genetic disorders. Preimplantation genetic screening. Obstetrics and gynecology. 2017; 8: 21-7. (in Russian)]
8. Balakier H., Sojecki A., Motamedi G., Bashar S., Mandel R., Librach C. Is the zona pellucida thickness of human embryos influenced by women’s age and hormonal levels? Fertil. Steril. 2012; 98(1): 77-83.
9. Шафеи Р.А., Сыркашева А.Г., Романов А.Ю., Макарова Н.П., Долгушина Н.В., Семенова М.Л. Хетчинг бластоцисты у человека. Онтогенез. 2017; 48(1): 8-20. [Shafei R.A., Syrkasheva A.G., Romanov A.Yu., Makarova NP, Dolgushina N.V., Semenova M.L. Hatching blastocyst in humans. Ontogenesis. 2017; 48 (1): 8-20. (in Russian)]
10. Moreno I., Franasiak J.M. Endometrial microbiota – new player in town. Fertil. Steril. 2017; 108(1): 32-9.
11. Franasiak J.M., Scott R.T. Endometrial microbiome. Curr. Opin. Obstet. Gynecol. 2017, 29(3): 146-52.
12. Franasiak J.M., Werner M.D., Juneau C.R., Tao X., Landis J., Zhan Y. et al. Endometrial microbiome at the time of embryo transfer: next-generation sequencing of the 16S ribosomal subunit. J. Assist. Reprod. Genet. 2016; 33(1): 129-36.
13. Mitchell C.M., Haick A., Nkwopara E., Garcia R., Rendi M., Agnew K. et al. Colonization of the upper genital tract by vaginal bacterial species in nonpregnant women. Am. J. Obstet. Gynecol. 2015; 212(5): 611. e1-9.
14. Припутневич Т.В., Мелкумян А.Р., Анкирская А.С., Трофимов Д.Ю., Муравьева В.В., Завьялова М.Г. Использование современных лабораторных технологий в видовой идентификаций лактобактерий при оценке состояния микробиоты влагалища у женщин репродуктивного возраста. Акушерство и гинекология. 2013; 1: 76-80. [Priputnevich T.V., Melkumyan A.R., Ankirskaya A.S., Trofimov D.Yu., Muravyova V.V., Zavyalova M.G. The use of modern laboratory technologies in the species identification of lactobacilli in assessing the state of the vaginal microbiota in women of reproductive age. Obstetrics and gynecology. 2013; 1: 76-80. (in Russian)]
15. Мелкумян А.Р., Припутневич Т.В., Анкирская А.С., Трофимов Д.Ю., Муравьева В.В., Муллабаева С.М., Завьялова М.Г. Видовой состав лактобактерий при различном состоянии микробиоты влагалища у беременных. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2013; 15(1): 72-9. [Melkumyan A.R., Priputnevich T.V., Ankirskaya A.S., Trofimov D.Yu., Muraveva V.V., Mullabayeva S.M., Zavyalova M.G. The species composition of lactobacilli in various states of the vaginal microbiota in pregnant women. Clinical microbiology and antimicrobial chemotherapy. 2013; 15 (1): 72-9.(in Russian)]
16. Сидорова И.С., Боровкова Е.И. Микрофлора половых путей у женщин репродуктивного возраста. М.: Практическая медицина; 2007. [Sidorova I.S., Borovkova E.I. The microflora of the genital tract in women of reproductive age. M .: Practical medicine; 2007. (in Russian)]
17. Анкирская А.С., Муравьева В.В. Опыт диагностики оппортунистических инфекций влагалища. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2001; 3(2): 190-4. [Ankirskaya A.S., Muravyova V.V. Experience in diagnosing opportunistic infections of the vagina. Clinical microbiology and antimicrobial chemotherapy. 2001; 3 (2): 190-4. (in Russian)]
18. Гомболевская Н.А., Марченко Л.А., Муравьева В.В., Анкирская А.С. Современные возможности этиологической диагностики хронического эндометрита. Акушерство и гинекология. 2012; 8-1: 40-5. [Gombolevskaya N.A., Marchenko L.A., Muravyova V.V., Ankirskaya A.S. Modern possibilities of etiological diagnosis of chronic endometritis. Obstetrics and gynecology. 2012; 8-1: 40-5. (in Russian)]
19. Cicineli Ε., Ballini Α., Marinaccio M., Poliseno A. Coscia M.F., Monno R., De Vito D. Microbiological findings in endometrial specimen: our experience. Arch. Gynecol. Obstet. 2012; 285(5): 1325-9.
20. Andrews W.W., Goldenberg R.L., Hauth J.C., Cliver S.P., Conner M., Goepfert A.R. Endometrial microbial colonization and plasma cell endometritis after spontaneous or indicated preterm versus term delivery. Am. J. Obstet. Gynecol. 2005;193(3, Pt 1): 739-45.
21. Чертовских М.Н., Кулинич С.И. Оптимизация прегравидарной подготовки больных с неудачными программами ВРТ при бесплодии. Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. 2013; 2-2: 83-6. [Chertovskikh M.N., Kulinich S.I. Optimization of pregravid preparation of patients with unsuccessful ART programs for infertility. Bulletin of the SSC of the RAMS. 2013; 2-2: 83-6. (in Russian)]
22. Hillier S.L., Rabe L.K., Meyn L., Macio I., Trucco G., Amortegui A. et al. Endometrial Gardnerella vaginalis and Atopobium Vaginea are associated with histologic endometritis among women with clinically diagnosed pelvic inflammatory disease (PID). Sex. Transm. Infect. 2013; 89(Suppl. 1): A36.
23. Кардымон О.Л., Кудрявцева А.В. Молекулярно-генетические методы для исследования микробиома кишечника. Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. 2016; 26(4): 4-13. [Kardymon O.L., Kudryavtseva A.V. Molecular genetic methods for the study of intestinal microbiome. Russian Journal of Gastroenterology, Hepatology, Coloproctology. 2016; 26 (4): 4-13. (in Russian)]
24. Rajendhran J., Gunasekaran P. Microbial phylogeny and diversity: small subunit ribosomal RNA sequence analysis and beyond. Microbiol. Res. 2011; 166(2): 99-110.
25. Курильщиков А.М., Тикунова Н.В., Кабилов М.Р. Методы и объекты метагеномных исследований. Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2012; 10(1): 191-201. [Kurilshchikov A.M., Tikunova N.V., Kabilov M.R. Methods and objects of metagenomic research. Bulletin of the NSU. Series: Biology, Clinical Medicine. 2012; 10 (1): 191-201. (in Russian)]
26. Simon C., Daniel R. Metagenomic analyses: past and future trends. Appl. Environ. Microbiol. 2011; 77(4): 1153-61.
27. Pettersson E., Lundeberg J., Ahmadian A. Generations of sequencing technologies. Genomics. 2009; 93(2): 105-11.
28. Moreno I., Codoñer F.M., Vilella F., Valbuena D., Martinez-Blanch J.F., Jimenez-Almazán J. et al. Evidence that the endometrial microbiota has an effect on implantation success or failure. Am. J. Obstet. Gynecol. 2016; 215(6): 684-703.
29. Verstraelen H., Vilchez-Vargas R., Desimpel F., Jauregui R., Vankeirsbilck N., Weyers S. et al. Characterisation of the human uterine microbiome in nonpregnant women through deep sequencing of the V1-2 region of the 16S rRNA gene. PeerJ. 2016; 4: e1602.
30. Tao X., Franasiak J.M., Zhan Y., Scott R.T. III, Rajchel J., Bedard J. et al. Characterizing the endometrial microbiome by analyzing the ultra-low bacteria from embryo transfer catheter tips in IVF cycles: next generation sequencing (NGS) analysis of the 16S ribosomal gene. Hum. Microb. J. 2017; 3: 15-21.

Received 15.06.2018

Accepted 22.06.2018